Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  328  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102006073--102006119
16
2.9
16
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9
60
31
0
2
65
1.04
102006099--102006129
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2.6
12
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0
53
32
3
0
64
1.09
102006310--102006368
21
2.8
20
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10
57
37
3
1
57
1.25
102006473--102006525
23
2.5
22
81
9
65
30
5
5
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1.44
102006560--102006606
23
2.0
25
91
8
80
38
0
6
55
1.26
102006809--102006855
17
2.7
18
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6
53
38
4
2
55
1.31
102006974--102007118
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6.9
20
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18
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31
6
3
58
1.39
102011005--102011059
22
2.5
22
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65
27
21
1
49
1.60
102011017--102011058
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26
21
0
52
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2.2
40
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137
25
27
21
25
1.99
102013720--102013846
40
3.2
40
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1
130
23
26
21
28
1.99
102022553--102022750
76
2.7
73
87
8
283
29
17
20
32
1.96
102022796--102023175
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5.0
74
84
8
421
31
16
19
32
1.94
102022800--102023160
152
2.4
149
83
10
428
32
16
19
31
1.94
102023146--102023203
29
2.0
29
89
0
89
18
20
36
24
1.95
102024327--102024524
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310
29
17
20
32
1.96
102025552--102025628
12
6.2
12
75
11
66
27
2
3
66
1.22
102025556--102025637
3
27.7
3
73
16
55
28
2
4
64
1.26
102025533--102025604
26
2.7
25
80
8
72
25
4
1
69
1.14
102025555--102025601
23
2.0
24
87
8
69
25
2
2
70
1.10
102025593--102025633
20
2.0
20
85
0
55
31
2
7
58
1.38
102025732--102025789
24
2.4
24
88
0
80
39
10
3
46
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102025824--102025907
24
3.5
25
71
21
63
32
1
7
59
1.32
102025859--102025929
16
4.1
17
80
14
74
32
2
1
63
1.18
102025831--102025927
12
7.6
12
70
20
54
31
2
5
60
1.30
102026043--102026090
20
2.3
22
79
13
57
27
2
2
68
1.11
102026121--102026149
15
1.9
15
100
0
58
34
0
0
65
0.93
102026290--102026371
26
3.1
26
65
13
60
29
3
4
62
1.33
102026408--102026454
23
2.0
25
91
8
80
38
0
6
55
1.26
102026749--102026824
34
2.3
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80
13
84
38
7
3
50
1.50
102033047--102033095
17
2.6
19
78
15
57
28
2
6
63
1.30
102035585--102035659
37
2.0
37
97
0
141
25
14
18
41
1.89
102035890--102035943
23
2.3
23
90
0
81
38
14
20
25
1.91
102036853--102037095
123
2.0
123
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1
371
28
22
16
32
1.95
102039776--102039805
2
15.5
2
93
6
53
50
0
0
50
1.00
102042029--102042700
206
3.3
205
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936
30
21
18
30
1.97
102050778--102050807
14
2.1
14
93
0
51
46
10
6
36
1.64
102055535--102055742
40
5.2
39
81
5
211
25
25
23
25
2.00
102055535--102055741
80
2.6
80
82
3
238
25
26
23
25
2.00
102063552--102063759
40
5.2
39
82
3
202
25
25
23
25
2.00
102063552--102063758
80
2.6
80
82
3
238
25
26
23
25
2.00
102067451--102067502
26
2.0
26
96
0
95
17
17
30
34
1.93
102071459--102071594
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2.0
68
100
0
272
36
11
16
35
1.85
102071907--102072231
90
3.7
89
86
2
440
26
6
14
52
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102071854--102072275
179
2.4
175
80
8
521
26
6
13
54
1.62
102072341--102072390
20
2.5
20
75
21
50
58
0
4
38
1.17
102072371--102072403
16
2.1
16
94
0
57
66
3
6
24
1.28
102074809--102074916
26
4.2
26
90
0
180
31
7
25
36
1.83
102077649--102077721
11
6.8
10
78
10
65
20
19
2
57
1.53
102077649--102077721
5
13.6
5
83
8
65
20
19
2
57
1.53
102077649--102077721
16
4.5
16
76
10
60
20
19
2
57
1.53
102077682--102077753
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3.5
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11
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29
9
0
61
1.28
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17
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70
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0
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16
0
52
1.44
102077823--102077900
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2.8
28
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0
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58
1.39
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23
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20
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22
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28
12
0
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29
4.5
29
83
12
136
27
13
0
57
1.42
102078572--102078610
18
2.2
18
85
0
51
28
12
0
58
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102078513--102078577
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2.8
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100
27
12
1
58
1.43
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68
23
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1
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1.41
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2.1
12
100
0
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0
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25
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24
1.99
102081506--102081709
48
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231
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1.99
102081671--102081776
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0
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28
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0
0
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24
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19
1
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0
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1.44
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2.9
22
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0
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47
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1.62
102114538--102114615
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2.7
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2
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34
1.63
102114531--102114615
14
5.9
14
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5
62
17
3
43
35
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102114807--102114862
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2.7
21
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0
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1
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1.64
102117153--102117201
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2.0
24
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1.9
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25
29
23
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1.99
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2.6
26
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0
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1.08
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0
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1.12
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1.29
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300
2.0
299
92
0
1006
22
17
9
50
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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102188603--102188644
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1.9
39
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0
114
34
25
5
34
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425