Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  367  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113100419--113100487
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2.2
31
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0
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0
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2.9
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2.0
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1.34
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14.0
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85
4
59
65
4
2
27
1.25
113139177--113139253
18
4.2
18
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11
68
63
5
5
25
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4
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9
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20
1.12
113139284--113139340
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2.2
26
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3
80
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3
3
21
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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0
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1.8
101
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18
26
28
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2.0
152
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17
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1.97
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2.1
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6
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2.0
20
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1.84
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1.9
23
95
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1.96
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1.9
22
100
0
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33
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2.1
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0
0
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2.3
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1.92
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6.2
26
94
1
270
36
24
4
33
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113173375--113173535
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2.1
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1
306
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4
33
1.77
113178913--113178965
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
113180447--113180608
26
6.2
26
92
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261
37
24
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32
1.79
113180447--113180608
78
2.1
78
96
0
297
37
24
5
32
1.79
113185942--113185978
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2.8
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21
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1.48
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1.62
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16
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2.2
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28
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2
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2.0
21
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60
2
0
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1.10
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Period
Size
Copy
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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0
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0
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0
2
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
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28
16
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23
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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128
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1.96
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2.1
20
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0
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18
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25
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108
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152
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2.5
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9
59
46
16
0
38
1.47

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425