Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  279  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86326043--86326118
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1.82
86326093--86326148
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3.5
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9
60
35
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1.83
86326079--86326150
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3.9
19
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123
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1.83
86326269--86326305
19
1.9
19
88
0
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10
2
13
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1.21
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86326496--86326724
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2.5
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25
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1.96
86326664--86326880
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2.8
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3.8
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2
415
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1.9
220
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0
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9
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18
1.9
18
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1.84
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39
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0
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25
27
19
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1.98
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18
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0
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3.9
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36
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10
36
1.83
86343760--86343840
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2.2
38
91
8
141
35
17
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37
1.83
86343770--86343849
37
2.2
37
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110
38
13
12
35
1.83
86345265--86345383
55
2.1
57
82
11
149
50
2
1
45
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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40
4.6
41
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233
26
21
22
29
1.99
86359147--86359278
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3.1
42
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4
178
25
18
24
31
1.97
86359153--86359301
40
3.7
40
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167
22
20
25
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1.98
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28
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33
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18
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0
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1.81
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29
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0
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23
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0
0
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2.0
22
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2.1
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0
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36
0
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38
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24
1.97
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3.9
40
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253
24
21
28
25
1.99
86401647--86401831
79
2.3
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80
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202
24
26
22
26
2.00
86401647--86401831
40
4.6
39
74
9
149
24
26
22
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86407161--86407299
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25
1.99
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2.00
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3.5
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1.99
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19
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19
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28
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1.9
119
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1.99
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46
3.0
46
89
0
202
26
31
8
34
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86479648--86479936
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47
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3
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26
29
11
32
1.91
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40
5.2
40
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2
305
21
28
24
25
1.99
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40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
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46
6.8
46
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13
223
23
28
18
29
1.98
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43
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1
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30
18
25
1.98
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22
1.9
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0
4
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20
23
1.98
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49
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0
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1.89
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100
0
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7
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1.9
154
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1
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20
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1.97
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19
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0
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53
0
0
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1.00
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0
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50
1.00
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30
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1.94
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0
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1.93
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207
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11
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1.88
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30
1.87
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27
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0
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1.91
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28
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2.3
82
83
7
229
23
27
24
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
24
2.00
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2.3
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7
227
23
27
24
24
2.00
86574172--86574363
40
4.8
39
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23
28
23
24
2.00
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2.0
30
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0
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1.81
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1.95
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28
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1.99
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92
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27
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1.99
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1.99
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130
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1.97
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19
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1.96
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0
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1.95
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70
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11
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1
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20
1.61
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2.1
47
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26
20
22
29
1.99
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24
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26
21
22
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1.99
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0
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25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86633782--86633913
29
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29
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1
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25
32
16
25
1.96
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26
23
1.99
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1
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30
22
24
21
1.99
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180
28
22
25
23
1.99
86644619--86644790
40
4.4
38
77
10
161
29
21
26
23
1.99
86652583--86652714
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25
1.96
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1.99
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20
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1.99
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27
20
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29
1.98
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24
4.4
24
89
7
151
26
21
20
30
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425