Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  25  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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23
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2.1
19
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43
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53
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1.9
34
84
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51
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7
37
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.7
35
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196
33
24
10
30
1.89
6471241--6471410
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217
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24
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190
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10
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1.90
6496251--6496421
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2.4
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221
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11
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25
2.0
25
100
0
102
45
3
23
27
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6526864--6526893
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0
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0
13
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2.6
12
94
0
53
41
12
16
29
1.85
6529267--6529306
17
2.5
17
88
8
57
20
30
5
45
1.72
6555907--6556038
70
1.9
69
90
1
210
50
5
6
37
1.50
6556514--6556565
18
2.8
18
80
11
52
61
1
1
34
1.18
6556959--6556998
7
6.0
7
94
5
66
85
0
15
0
0.61
6556961--6556997
6
5.8
6
93
6
56
86
0
13
0
0.57
6556959--6556997
13
3.0
13
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0
15
0
0.62
6580024--6580102
39
2.0
39
95
0
140
45
5
25
24
1.73
6595438--6596306
137
6.3
137
92
0
1362
33
19
20
27
1.96
6597690--6597764
39
1.9
39
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125
46
5
24
24
1.73
6599761--6599795
8
4.4
8
85
0
52
51
14
2
31
1.57
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26
4.2
26
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2
168
36
24
5
33
1.79
6616305--6616366
25
2.5
25
86
5
90
40
17
19
22
1.91
6616905--6616934
15
2.0
15
93
0
51
30
20
3
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1.66
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2
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2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
6624510--6624567
20
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5
12
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74
1.21
6626470--6626511
15
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15
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25
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7
7
64
1.43
6627727--6627764
20
1.9
20
88
0
58
36
26
13
23
1.91
6628240--6628292
16
3.5
15
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7
72
67
1
0
30
1.01
6628240--6628292
15
3.6
14
82
12
70
67
1
0
30
1.01
6629005--6629061
21
2.5
22
83
8
71
28
0
1
70
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6629023--6629089
17
3.8
18
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16
61
31
1
1
65
1.10
6629005--6629071
23
3.0
21
79
12
71
29
1
1
67
1.09
6629390--6629447
30
2.0
30
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3
82
39
12
5
43
1.64
6635944--6636039
47
2.0
47
95
0
174
30
25
13
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1.94
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3
160.0
3
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12
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1
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14
2.9
14
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7
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60
2
4
31
1.30
6640109--6640250
26
5.4
26
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9
74
60
0
9
28
1.34
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41
2.0
41
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58
1
10
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1.38
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68
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0
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23
24
23
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5.6
88
88
0
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22
23
22
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1.98
6642940--6643260
44
7.3
44
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21
24
21
32
1.98
6650507--6650847
3
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3
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0
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1.32
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17
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17
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64
0
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27
1.22
6650554--6650684
48
2.8
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13
115
63
0
8
28
1.23
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58
2.4
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135
58
0
11
29
1.33
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41
2.0
41
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5
108
58
1
10
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1.38
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2.0
21
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0
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0
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1.57
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2.2
17
90
0
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59
2
2
35
1.26
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45
3.7
45
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7
140
25
23
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30
1.98
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89
2.0
89
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220
25
23
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90
2.2
89
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2
215
26
24
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1.97
6679258--6679300
19
2.2
20
83
4
52
48
4
16
30
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6683188--6683224
17
2.2
17
90
0
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59
2
2
35
1.26
6686258--6686313
26
2.2
26
100
0
112
30
7
26
35
1.83
6687800--6687852
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
6690644--6691142
166
3.0
168
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1
896
35
4
25
34
1.77
6691384--6691591
25
8.2
25
69
14
79
34
6
4
55
1.45
6691752--6691791
16
2.5
16
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8
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30
0
2
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1.04
6691744--6691796
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1
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0
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0
0
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1.00
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2.0
37
82
10
89
61
2
6
28
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425