Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  222  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67237994--67238042
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3.1
15
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0
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0
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20
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27
1.98
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20
20
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20
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25
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2.3
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24
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26
1.97
67276276--67276547
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46
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10
223
23
31
18
26
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16
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2.1
13
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0
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1.75
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22
2.0
22
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4
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26
21
7
45
1.77
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49
4.7
49
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297
29
27
18
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1.98
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15
2.5
15
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4
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56
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15
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2
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28
27
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25
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4.7
21
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7
60
26
27
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29
11
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1.91
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47
2.8
47
85
0
170
22
16
27
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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0
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16
2.8
15
72
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50
48
2
2
46
1.27
67318072--67318123
16
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15
71
12
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15
5
1
76
1.05
67318071--67318138
17
4.1
16
73
3
55
16
4
2
76
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67318099--67318138
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2
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2
0
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22
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21
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39
0
1
58
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1.33
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21
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0
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0
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0
0
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53
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51
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157
28
28
15
27
1.96
67331291--67331468
50
3.5
50
79
2
149
30
26
17
24
1.98
67331335--67331464
52
2.6
50
81
2
143
33
27
14
24
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67338368--67338403
18
2.0
19
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1.79
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2.1
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105
18
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34
33
1.89
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29
3.5
29
81
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116
25
35
15
23
1.94
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29
2.5
29
90
0
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24
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13
3.2
13
96
0
73
14
31
34
19
1.92
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2.5
24
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75
1
17
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29
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1.97
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4.0
399
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14
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1.89
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2.0
799
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0
2835
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16
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5.4
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24
25
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2.00
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26
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25
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2.00
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2.1
80
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25
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1.99
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26
23
26
23
2.00
67375224--67375440
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1.8
119
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283
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26
23
2.00
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1.19
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17
2.4
17
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8
55
27
2
2
67
1.16
Indices
Period
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Copy
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Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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26
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23
30
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
29
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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