Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  87  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25021828--25022321
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2
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0
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0
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22
2
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1.25
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15
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20
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0
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1.51
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20
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46
20
0
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1.51
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20
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16
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26
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2.0
21
100
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2.3
23
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0
90
16
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2.2
25
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1.9
13
100
0
50
44
0
8
48
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25086887--25086965
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6
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5
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17
3
1
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0.99
25086898--25086965
12
6.1
11
86
6
77
17
4
1
76
1.03
25086887--25086965
5
15.0
5
79
18
81
17
3
1
77
0.99
25089881--25089913
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
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2.0
143
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423
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10
9
32
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1.8
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20
12
33
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19
2.2
19
91
8
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65
0
0
34
0.93
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1.24
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2.2
20
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63
8
0
27
1.23
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2.0
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2
0
31
1.06
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15
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2
0
34
1.13
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21.0
9
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122
62
2
0
34
1.13
25092867--25093047
28
6.5
26
71
15
114
62
2
0
33
1.13
25092869--25093048
47
3.8
45
76
11
143
62
2
0
33
1.14
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7
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0
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0
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0.58
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18
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0
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1.15
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30
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26
75
18
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35
0
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58
1.26
25093777--25093836
30
2.0
30
87
6
86
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1
3
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1.20
25093684--25093911
9
24.8
9
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86
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3
60
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63
62
11
1
24
1.39
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22
3.3
22
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67
59
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1
31
1.33
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21
2.4
21
82
3
64
16
0
10
73
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25094465--25094511
21
2.2
21
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19
0
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72
1.10
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2.0
21
90
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24
7
41
26
1.81
25112572--25112606
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2.7
13
95
0
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42
25
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22
1.82
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2.0
20
85
14
55
17
5
15
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1.51
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1.9
32
96
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113
42
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6
29
1.78
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24.3
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74
14
117
49
16
15
18
1.80
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4.5
31
82
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142
50
15
15
18
1.79
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3.2
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1.95
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22
18
22
1.95
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22
2.6
22
86
0
71
36
22
20
20
1.95
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27
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27
87
2
261
25
19
19
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1.96
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27
4.7
27
78
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116
27
7
22
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1.81
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20
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1.99
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1.99
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4.2
40
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12
184
23
22
28
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25172317--25172484
80
2.1
79
87
4
239
23
22
28
26
1.99
25180317--25180484
40
4.2
40
80
12
184
23
22
28
26
1.99
25180317--25180484
80
2.1
79
87
4
239
23
22
28
26
1.99
25192537--25192604
33
2.1
32
83
8
84
38
8
17
35
1.81
25198605--25198632
13
2.2
13
100
0
56
50
7
0
42
1.30
25199082--25199123
20
2.0
21
90
4
68
50
0
19
30
1.48
25199808--25199909
33
3.1
32
77
4
105
31
10
22
35
1.89
25199819--25199920
33
3.1
32
76
9
107
31
11
23
33
1.91
25199860--25199927
33
2.1
32
86
8
93
35
10
20
33
1.87
25200970--25201074
30
3.5
30
89
0
165
20
40
28
10
1.86
25201952--25202040
41
2.2
41
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4
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20
22
24
32
1.98
25203328--25203501
46
3.8
46
78
15
187
21
21
29
28
1.98
25203322--25203493
93
1.8
93
89
0
272
20
21
29
27
1.98
25209682--25209895
40
5.4
40
88
4
285
25
29
22
22
1.99
25209682--25209895
79
2.7
79
87
5
283
25
29
22
22
1.99
25212080--25212253
46
3.8
44
79
6
163
22
21
27
28
1.99
25212076--25212246
92
1.9
91
88
1
261
23
21
28
26
1.99
25214532--25214623
42
2.2
42
82
2
103
28
26
22
22
1.99
25216310--25216345
18
2.0
18
100
0
72
44
11
27
16
1.82
25225161--25225370
40
5.2
40
88
2
296
21
28
24
25
1.99
25232741--25232900
29
5.5
30
88
8
213
26
25
14
33
1.94
25232741--25232900
59
2.8
57
88
4
214
26
25
14
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25235261--25235437
49
3.6
49
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7
232
26
18
26
28
1.98
25235251--25235445
100
1.9
101
90
4
313
25
18
26
29
1.98
25243107--25243206
28
3.5
28
84
6
103
29
27
15
29
1.96
25246258--25246465
40
5.2
39
84
1
218
25
25
22
25
2.00
25246258--25246463
80
2.6
81
84
3
247
25
26
22
25
2.00
25254193--25254265
29
2.5
29
93
0
101
26
31
16
26
1.96
25257436--25257577
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
22
1.99
25257475--25257603
40
3.2
39
84
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152
24
22
27
25
2.00
25265461--25265602
40
3.5
40
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1
124
27
23
26
22
1.99
25265500--25265628
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
25268952--25269081
40
3.2
40
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4
165
23
24
28
23
2.00
25268915--25269081
80
2.1
79
81
7
196
25
23
27
23
2.00
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1.8
123
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2
297
30
10
23
34
1.89
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40
3.0
40
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5
150
23
25
28
22
1.99
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2.6
933
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0
4684
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19
22
28
1.98
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7
187
28
18
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25
1.98
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90
2.4
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226
29
18
26
26
1.98
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20
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9
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5
35
2
56
1.35
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2.7
54
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2
206
25
25
16
32
1.96
25291961--25291993
7
4.7
7
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0
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30
0
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24
1.53
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14
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14
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0
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29
2
46
21
1.64
25291961--25292001
21
2.0
21
85
0
55
29
2
46
21
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25293870--25293899
15
2.0
15
93
0
51
30
6
16
46
1.73
25301332--25301425
29
3.2
29
96
0
170
26
28
15
28
1.96
25301294--25301425
58
2.3
58
84
2
167
25
33
15
25
1.95
25324293--25324334
14
2.8
16
79
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45
0
0
54
0.99
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16
1.9
15
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33
0
0
66
0.92
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5.9
9
73
4
54
51
11
9
27
1.67
25327382--25327434
19
2.9
18
91
5
88
49
11
9
30
1.70
25331863--25331935
27
2.7
27
93
2
119
31
24
13
30
1.94
25346309--25346444
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5.7
23
82
8
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36
19
22
22
1.95
25351009--25351034
12
2.2
12
100
0
52
7
38
23
30
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425