Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  151  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
45900895--45901306
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2.6
27
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2.1
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93
0
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28
2.2
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1
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21
28
28
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0
0
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1.9
18
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0
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0
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13
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0
0
31
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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15
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51
20
0
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2.0
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2.0
20
100
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0
0
50
1.00
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2
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0
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18
75
60
7
0
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1.9
24
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74
37
0
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2
1.09
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2.0
19
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2.2
22
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29
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133
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21
27
23
1.99
46012259--46012364
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2.7
40
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27
22
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20
1.99
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43
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26
0
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1.98
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2.1
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90
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24
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278
26
21
23
28
1.99
46031910--46032099
47
4.0
48
91
4
296
26
21
23
28
1.99
46031910--46032099
71
2.7
72
90
4
287
26
21
23
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
46032156--46032232
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35
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0
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12
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11
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19
12
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1.89
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25
1.9
25
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0
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25
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1.94
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27
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9
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1.85
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2.1
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24
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278
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21
23
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1.99
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4.0
48
90
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291
26
21
22
29
1.99
46037113--46037303
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2.7
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289
26
21
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1.99
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20
9
35
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20
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11
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121
36
17
21
24
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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3.0
14
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0
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1.51
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7
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0
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1.76
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100
0
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19
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1
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1.20
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135
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1.98
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2.0
27
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26
17
30
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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2.9
42
80
8
103
35
24
14
25
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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0
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22
8
37
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425