Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  278  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85942773--85942852
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39
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0
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2.0
20
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85944323--85944577
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25
25
22
26
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85957705--85957910
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114
29
13
26
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1.94
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2.6
27
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1.95
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4.6
46
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23
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1.96
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132
2.5
132
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3
395
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19
16
28
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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133
1.8
133
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0
346
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20
18
29
1.97
86041118--86041447
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2.5
132
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2
402
36
19
16
28
1.93
86052796--86052943
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2.7
55
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176
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21
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35
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0
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1.11
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0
0
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0
0
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0
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0
0
20
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0
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120
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16
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1.96
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2.1
42
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15
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1.94
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48
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18
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1.95
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1.97
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2.8
25
91
0
104
25
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24
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2.00
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1.81
86083509--86083607
27
3.7
27
82
4
119
29
6
22
42
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86083639--86083730
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1.85
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5.1
21
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6
110
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20
14
1.85
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4.9
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17
70
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16
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1.81
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1.97
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1.97
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2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
0
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40
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2
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25
27
21
25
1.99
86144829--86144995
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2.1
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205
25
27
21
25
1.99
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17
23
1.96
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40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
86152827--86152993
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
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17
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19
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17
23
1.96
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0
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2.00
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20
1
0
77
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
22
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4.1
40
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239
23
23
26
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
23
25
26
2.00
86282009--86282228
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26
25
2.00
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0
0
31
0.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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