Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  42  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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70
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2.4
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0
60
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20
1.05
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2.0
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10
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2.0
20
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1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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224
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17
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36
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0
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50
45
0
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47
1.29
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20
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16
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2
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45
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25
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23
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1.81
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26
4.2
26
93
0
189
32
7
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1.83
11137744--11137894
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69
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10
186
38
8
7
45
1.63
11138771--11138838
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2.1
32
100
0
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22
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3.7
47
78
16
171
26
29
21
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11153445--11153615
92
1.8
92
93
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29
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22
1.99
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2.3
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57
17
16
8
1.64
11155981--11156048
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4.6
14
75
10
64
57
17
16
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1.64
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3.8
45
77
10
183
28
28
21
22
1.99
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93
1.8
93
91
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283
27
28
21
22
1.99
11158982--11159168
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4.0
45
71
20
136
28
27
20
22
1.99
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17
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9
60
41
2
2
53
1.28
11174894--11174932
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1.9
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1.84
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1.92
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2.0
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10
6
47
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11244441--11244572
65
2.0
65
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10
162
43
14
4
37
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11246127--11246176
24
2.1
23
82
10
57
38
24
0
38
1.56
11252486--11252544
21
2.8
22
85
7
70
23
0
6
69
1.12
11252515--11252573
26
2.4
24
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10
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28
0
3
67
1.06
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27
10.6
27
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5
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20
8
30
1.82
11254687--11254972
81
3.5
81
84
0
367
40
20
8
30
1.82
11254687--11254945
54
4.8
54
91
3
407
40
20
8
30
1.82
11254687--11255020
81
4.1
82
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6
218
41
20
8
30
1.81
11254687--11255081
27
14.6
27
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40
20
8
31
1.82
11255065--11255435
27
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27
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4
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35
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19
26
1.95
11255694--11255745
27
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0
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0
0
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1.00
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23
20
35
1.96
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17
20
15
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1.83
11256007--11256085
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2.5
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0
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17
20
15
46
1.83
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18
2.2
18
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0
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2
0
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1.12
11259627--11259665
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14
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7
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58
2
0
38
1.12
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11
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0
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0
0
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0.92
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3
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26
22
21
1.99
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2.0
47
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0
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18
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1.88
11263069--11263224
27
5.8
27
83
11
187
34
22
24
18
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11263087--11263224
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2.6
54
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23
17
1.96
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2.3
26
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23
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1.90
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5.9
27
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34
21
24
19
1.96
11270117--11270257
54
2.6
54
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2
230
34
22
24
18
1.96
11270363--11270425
26
2.3
26
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1.90
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5
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0
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1
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1.22
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1.9
18
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43
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1.97
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25
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1.97
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86
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2.0
43
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12
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1.82
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23
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28
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0
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52
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1.94
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1.90
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1.10
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2
0
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0
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4.8
12
95
0
107
0
27
0
72
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11327593--11327644
24
2.2
24
85
0
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3
1
53
1.30
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2.0
44
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18
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22
1.97
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2.4
21
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0
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30
24
1.96
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24
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1.94
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49
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1.92
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2.0
53
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21
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1.84
11340788--11341104
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3.3
94
87
6
442
29
31
7
32
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425