Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  347  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107446609--107446643
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16
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70
0
2
27
1.01
107454465--107454527
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3.9
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142
35
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101
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13
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0
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0
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3.9
12
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0
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29
40
4
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107489917--107490061
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107489939--107490061
33
3.7
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0
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15
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2.7
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0
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2.0
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1.98
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156
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18
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25
1.98
107513157--107513658
156
3.2
152
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463
30
18
24
26
1.98
107513942--107513986
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2.3
20
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37
12
12
37
1.82
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3.9
19
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123
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107516983--107517064
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15
36
1.81
107518866--107519041
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3.8
46
80
12
225
21
21
28
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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27
1.98
107521984--107522062
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5.4
15
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10
17
13
58
1.63
107521975--107522061
29
3.0
29
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95
10
17
16
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1.67
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2.8
46
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231
20
21
28
29
1.98
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26
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1.86
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24
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0
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3
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9
71
20
91
46
15
2
36
1.60
107542450--107542561
16
7.0
16
78
11
113
45
16
2
35
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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2
35
1.61
107542450--107542599
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1.9
80
94
0
264
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2
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1.60
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9
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9
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0
36
1.47
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0
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24
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107558517--107558700
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81
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23
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13
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1.53
107565223--107565307
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9
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1
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1.53
107565262--107565301
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5.2
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0
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0
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0
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107566691--107566743
21
2.5
22
75
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5
3
52
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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22
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2.0
108
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1.96
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2.2
131
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298
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20
26
1.96
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3.0
131
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415
33
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30
1.94
107595772--107596278
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3.9
133
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0
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0
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0
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27
29
20
21
1.98
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28
1.97
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2.0
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1.96
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4.1
48
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13
153
25
15
27
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107649799--107649823
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0
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0
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0
0.53
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44
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1.96
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2.0
219
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1.96
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0
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50
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35
0
0
64
0.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425