Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  53  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14272562--14272598
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2.2
17
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0
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0
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13
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0
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0
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0
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0
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2.7
206
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1
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38
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0
38
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44
2.6
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2
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22
27
1.92
14332259--14332392
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3.0
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4
153
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14
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2.0
20
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20
2.0
20
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0
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32
0
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1.17
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111
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1
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1
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1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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13
25
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33
2.2
33
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0
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13
5
19
1.51
14337169--14337214
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2.5
18
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65
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8
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43
1.34
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1.9
18
94
5
61
58
5
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26
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10
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2.0
27
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10
6.0
10
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2.5
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48
30
0
21
1.51
14348519--14348558
14
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14
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1.64
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40
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20
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2.1
155
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19
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1.96
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21
100
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9
11
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26
2.2
26
82
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0
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53
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1.71
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207
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0
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43
2.0
43
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1.95
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34
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0
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2.5
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165
20
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19
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1.90
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18
1.9
18
88
0
52
17
25
17
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1.90
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117
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0
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2.8
46
83
8
146
29
26
14
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14377045--14377139
49
2.0
48
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172
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14
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1.95
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146
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27
13
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1.94
14377238--14377386
31
4.8
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20
27
1.99
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50
2.5
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23
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93
1.8
93
88
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261
21
21
28
28
1.99
14381018--14381188
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1.98
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Copy
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Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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28
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140
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1.98
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10
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36
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
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0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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160
23
26
23
27
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425