Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  321  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100116943--100117159
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5.4
40
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2
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22
26
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100116943--100117162
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2.8
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22
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2.00
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3.2
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4.6
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1
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1.30
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1
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0
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1.15
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21
2.6
22
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5
69
52
3
3
40
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
34
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3
38
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2.9
23
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14
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1
0
44
1.09
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2.0
48
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1
43
1.19
100125252--100125292
9
4.8
9
93
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12
50
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1
25
0.95
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10.5
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9
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75
0
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22
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18
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0
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19
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4
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1.30
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5
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0
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0
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2.5
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107
29
22
25
22
1.99
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24
23
26
25
2.00
100160895--100160977
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2.3
35
86
12
107
13
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31
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14
0
2
82
0.77
100165017--100165065
16
3.0
16
87
3
62
57
14
14
14
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100165024--100165073
17
3.0
17
91
2
75
56
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12
16
1.68
100166002--100166196
29
6.7
29
80
7
164
26
12
23
37
1.90
100165998--100166165
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1.9
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214
25
12
23
38
1.90
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3.6
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18
29
24
1.98
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1.8
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20
28
25
1.99
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5.6
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11
169
26
19
29
24
1.98
100197475--100197530
19
2.8
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16
25
1.95
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2.0
343
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17
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1.80
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4.7
49
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10
198
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18
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1.97
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22
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3.0
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1
371
22
22
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0
197
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25
29
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5
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25
29
1.96
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6
7.2
6
92
2
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15
25
0
59
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1
7
56
1.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425