Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   

This is table  295  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91583668--91583885
79
2.7
79
79
6
183
24
23
27
24
2.00
91591718--91591909
40
4.8
39
78
5
145
24
23
28
23
2.00
91591718--91591902
79
2.3
82
82
7
220
24
23
27
24
2.00
91591771--91591935
79
2.1
79
82
4
199
24
23
27
24
2.00
91594709--91594766
25
2.3
25
85
11
75
63
1
13
20
1.38
91613548--91613629
26
3.2
26
94
0
146
36
28
4
30
1.78
91614694--91614732
20
2.0
20
84
0
51
51
12
0
35
1.40
91615629--91615663
5
7.0
5
90
0
52
62
2
0
34
1.10
91619952--91619995
23
2.0
21
82
8
52
54
0
11
34
1.36
91620254--91620304
18
2.8
18
80
8
59
5
31
0
62
1.19
91621525--91621661
28
4.9
28
86
0
177
19
24
18
37
1.94
91628591--91629305
356
2.0
356
100
0
1430
28
14
26
30
1.95
91629807--91629869
28
2.2
28
82
0
72
17
22
20
39
1.92
91638409--91638449
19
2.2
19
86
0
55
43
4
9
41
1.59
91638606--91638711
53
2.0
53
98
0
203
28
33
22
16
1.95
91640042--91640244
40
5.1
39
86
3
194
26
27
21
24
1.99
91640042--91640244
80
2.5
78
83
6
244
26
27
21
24
1.99
91648157--91648362
40
5.2
40
83
4
240
26
27
21
25
1.99
91655416--91655597
46
4.0
46
97
0
337
34
7
27
31
1.84
91655601--91655711
47
2.4
47
89
0
168
36
9
27
27
1.87
91658270--91658532
40
6.6
40
94
0
429
25
21
28
25
1.99
91661967--91662148
46
4.0
46
97
0
337
34
7
27
31
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91662152--91662262
47
2.4
47
89
0
168
36
9
27
27
1.87
91665783--91665888
53
2.0
53
96
0
194
29
33
21
16
1.95
91667218--91667421
40
5.1
39
83
3
178
26
26
21
24
1.99
91667218--91667421
80
2.5
78
82
6
228
26
26
21
24
1.99
91679033--91679581
272
2.0
272
97
0
1037
36
19
11
32
1.87
91687972--91688197
50
4.5
50
78
2
240
26
17
26
29
1.98
91687970--91688156
101
1.9
101
88
0
284
27
18
25
28
1.98
91688409--91688438
16
1.9
15
93
6
51
40
3
23
33
1.71
91692046--91692085
16
2.5
16
88
8
55
5
17
0
77
0.94
91692969--91693013
20
2.2
20
92
0
72
48
6
0
44
1.29
91711151--91711176
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
91712571--91712604
17
1.9
18
88
5
52
58
0
0
41
0.98
91712992--91713033
21
2.0
21
86
4
59
54
2
2
40
1.26
91713386--91713427
20
2.1
20
82
8
50
30
9
0
59
1.29
91714409--91714476
29
2.3
30
87
5
93
29
7
16
47
1.73
91714422--91714490
29
2.4
28
82
4
84
36
5
14
43
1.70
91714646--91714799
56
2.8
56
83
0
200
45
16
7
29
1.76
91717500--91717585
40
2.2
39
82
2
100
31
26
15
26
1.95
91719794--91719961
40
4.2
40
74
3
151
26
26
21
26
1.99
91736167--91736226
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
91747029--91747158
46
2.8
48
79
14
155
30
26
20
23
1.98
91747027--91747174
46
3.2
46
73
17
146
29
27
18
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91747578--91747637
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
91755345--91755396
2
26.0
2
100
0
104
50
0
0
50
1.00
91770257--91770350
46
2.0
47
89
6
147
23
17
30
28
1.97
91772016--91772186
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
91779951--91780136
40
4.7
39
77
9
162
27
22
26
24
2.00
91781600--91781711
45
2.5
44
85
5
145
27
16
30
25
1.97
91784756--91785147
27
14.5
27
85
0
469
38
19
9
31
1.85
91785186--91785677
27
18.3
27
84
2
542
35
18
18
27
1.94
91785186--91785676
54
9.1
54
85
4
616
36
17
18
27
1.94
91786249--91786316
28
2.5
27
81
9
75
23
23
17
35
1.95
91786436--91786514
31
2.5
31
85
4
97
17
17
13
50
1.78
91786464--91786523
6
9.8
6
76
16
61
16
18
16
48
1.82
91788471--91788801
27
12.3
27
86
0
437
39
20
9
31
1.84
91788471--91788868
81
4.9
82
81
4
384
38
21
9
30
1.85
91788471--91788872
27
14.9
26
78
6
291
38
20
9
31
1.85
91788904--91789324
27
15.6
27
84
1
477
38
19
16
25
1.93
91788904--91789390
54
9.1
54
84
3
529
37
19
16
26
1.92
91789954--91790035
27
3.0
26
82
8
92
19
21
21
36
1.95
91790153--91790214
25
2.5
25
89
0
88
19
16
16
48
1.81
91790150--91790222
6
11.8
6
71
16
51
19
16
15
49
1.80
91794079--91794232
56
2.8
56
86
4
211
44
16
9
30
1.78
91797273--91797416
40
3.6
40
98
0
270
29
29
18
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91814798--91814893
48
2.0
48
97
0
183
40
5
16
37
1.71
91824053--91824143
28
3.3
27
82
10
112
34
19
23
23
1.97
91827531--91827581
25
2.0
26
81
11
61
43
9
7
39
1.67
91829373--91829514
40
3.5
40
87
3
189
27
26
19
27
1.99
91829345--91829530
40
4.6
41
84
6
172
26
25
21
25
1.99
91829345--91829530
80
2.3
80
80
9
193
26
25
21
25
1.99
91831460--91831499
19
2.1
19
86
9
55
32
2
7
57
1.40
91836500--91836770
135
2.0
135
98
0
524
40
11
15
33
1.83
91837210--91837262
23
2.3
23
86
0
79
33
13
26
26
1.93
91856049--91856091
17
2.6
16
88
3
59
60
2
32
4
1.30
91863537--91863594
31
1.9
30
82
10
73
29
29
8
32
1.87
91863503--91863611
47
2.4
45
86
7
139
27
28
11
33
1.91
91866163--91866203
20
2.0
20
85
9
55
46
17
7
29
1.74
91867413--91867608
40
4.9
40
94
0
338
26
30
22
20
1.99
91870187--91870244
31
1.9
30
82
10
73
29
29
8
32
1.87
91870153--91870261
47
2.4
45
86
7
139
27
28
11
33
1.91
91872804--91872844
20
2.0
20
85
9
55
46
17
7
29
1.74
91874055--91874250
40
4.9
40
94
0
338
26
30
22
20
1.99
91876829--91876886
31
1.9
30
82
10
73
29
29
8
32
1.87
91876795--91876903
47
2.4
45
84
7
130
26
28
11
33
1.90
91879249--91879273
4
6.2
4
100
0
50
24
0
0
76
0.80
91881837--91881865
12
2.4
12
100
0
58
44
17
20
17
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91882854--91882908
26
2.2
24
80
6
65
32
18
21
27
1.96
91883034--91883113
19
4.2
19
76
4
81
27
8
22
41
1.83
91883069--91883117
18
2.5
20
77
12
57
28
12
16
42
1.84
91886223--91886247
13
1.9
13
100
0
50
16
24
40
20
1.91
91894280--91894451
93
1.8
93
88
2
265
28
27
20
22
1.99
91894272--91894447
46
3.8
46
75
11
180
29
27
20
22
1.99
91907405--91907437
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
91908662--91908727
20
3.2
20
70
8
60
22
9
27
40
1.84
91908659--91908743
42
2.0
42
90
0
134
22
7
25
44
1.78
91908676--91908746
20
3.5
20
70
9
54
21
4
29
45
1.70
91915957--91916131
46
3.8
45
78
9
183
22
29
20
27
1.98
91928692--91928783
46
2.0
46
100
0
184
19
32
19
28
1.96
91933064--91933428
47
7.7
47
74
12
234
23
27
19
30
1.98
91933061--91933426
141
2.6
138
77
10
364
22
27
19
29
1.98
91935547--91935610
25
2.6
26
80
9
64
32
20
20
26
1.97
91935736--91935815
19
4.2
19
79
4
90
28
6
23
41
1.79
91935738--91935819
39
2.1
39
88
2
121
30
6
21
41
1.78
91941170--91941432
39
6.7
39
88
1
393
19
20
29
30
1.97
91949013--91949213
40
5.0
40
91
1
314
23
22
27
25
2.00
91957062--91957304
40
6.1
40
94
0
407
22
23
27
26
2.00
91965308--91965439
55
2.4
55
75
2
140
28
26
27
17
1.98
91967149--91967221
35
2.1
35
100
0
146
64
5
13
16
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91968419--91968585
67
2.5
67
83
7
180
32
17
28
21
1.96
92023321--92023658
49
6.9
49
94
1
590
29
30
8
31
1.87
92023321--92023835
147
3.7
145
79
13
592
29
30
8
31
1.87
92023630--92023686
28
2.0
28
100
0
114
29
28
14
28
1.95
92023483--92023833
175
2.0
175
97
0
666
30
30
9
30
1.88
92023581--92023735
77
2.0
77
96
0
283
30
29
9
30
1.89
92023532--92023784
126
2.0
126
96
0
470
30
30
9
30
1.89
92023658--92023835
49
3.6
49
96
0
329
29
29
9
30
1.89
92030693--92030859
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
92038681--92038847
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425