Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  335  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103981074--103981155
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20
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4
0
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1.11
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2
0
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0.99
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56
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103984645--103984746
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0
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15
100
0
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2.4
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0
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0.90
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51
78
2
0
19
0.86
104029011--104029065
15
4.2
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53
76
1
0
21
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2.2
18
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10
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25
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2
0
20
0.88
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23
2.4
23
83
16
80
75
1
0
23
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
0
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2.4
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7
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8
11
62
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2.1
61
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22
11
7
58
1.58
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29
2.0
29
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0
14
56
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17
2.5
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30
2
4
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1.29
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1.9
13
100
0
50
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1.96
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29
28
20
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1.98
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19
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1.98
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28
19
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1.98
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1.87
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178
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18
22
1.97
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3.1
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114
29
27
19
23
1.98
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13
5.5
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26
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25
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0
18
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16
26
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17
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37
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14
17
1.89
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133
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2.2
21
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0
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29
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1.76
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115
2.4
106
78
10
311
55
14
1
27
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
104076257--104076314
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2.0
29
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29
20
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1.82
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24
2.4
24
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0
71
41
32
5
20
1.75
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21
2.4
21
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66
46
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12
1.70
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13
2.3
15
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6
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1.20
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1.09
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18
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0
3
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1.09
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0
0
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39
11
12
37
1.79
104102142--104102240
18
5.6
18
87
4
148
39
12
12
36
1.80
104102549--104102582
12
2.9
11
87
12
50
35
0
0
64
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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20
61
36
2
0
59
1.18
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16
2.0
16
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6
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35
0
0
64
0.94
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7
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7
69
18
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38
4
0
57
1.20
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3
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3
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5
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0
0
69
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2
20.0
2
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0
43
0
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78
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78
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1
484
31
20
24
24
1.98
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156
2.3
159
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494
31
19
24
24
1.98
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5.1
45
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30
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17
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1.80
104115308--104115379
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3.9
19
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0
0
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24
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0
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0
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2.00
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0
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25
2.00
104139423--104139628
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2.6
80
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1
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25
22
26
25
2.00
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2
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23
2.4
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6
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14
32
1.66
104150923--104151033
54
2.1
54
98
1
215
58
12
1
27
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
104150934--104151045
53
2.1
54
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1
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2
20.5
2
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0
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19
23
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1.9
20
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28
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286
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1.96
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29
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1.95
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28
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22
20
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1.96
104213946--104214077
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1.96
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0
0
50
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1.93
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0
0
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1.00
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2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
104237472--104237530
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25
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22
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0
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0
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104269254--104269317
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0
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1.00
104271104--104271231
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2.1
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1.97
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2.0
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180
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20
20
1.97
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13
2.0
13
100
0
52
30
23
30
15
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425