Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   

This is table  210  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64179233--64179297
34
2.0
34
84
6
89
30
26
16
26
1.97
64181141--64181274
26
5.2
26
95
0
232
36
23
7
32
1.83
64181951--64181975
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
64183161--64183196
12
3.1
12
92
4
56
80
0
0
19
0.71
64183165--64183199
6
5.8
6
93
0
61
82
0
0
17
0.66
64183424--64183488
15
4.4
15
74
16
64
10
12
12
64
1.50
64187029--64187182
27
5.5
27
82
4
164
31
25
14
28
1.95
64187029--64187182
29
5.5
28
81
6
145
31
25
14
28
1.95
64187029--64187132
55
1.9
55
100
0
208
35
24
13
26
1.92
64188686--64188870
51
3.7
49
87
4
246
26
19
25
28
1.99
64188686--64188870
100
1.8
102
86
4
268
26
19
25
28
1.99
64207189--64207254
18
3.3
18
70
22
60
56
0
22
21
1.43
64207182--64207265
42
2.0
42
100
0
168
52
0
26
21
1.47
64211947--64212122
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
64211943--64212114
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
64215136--64215199
29
2.2
29
91
0
101
25
25
12
37
1.91
64220532--64220569
19
2.1
19
85
9
53
65
7
0
26
1.19
64222557--64222728
93
1.8
93
92
0
290
29
29
20
20
1.98
64222550--64222725
46
3.8
46
77
12
189
30
29
20
19
1.97
64226137--64226276
37
3.8
37
91
0
235
26
31
18
23
1.97
64226413--64226787
48
7.9
48
95
1
639
28
27
9
34
1.88
64226413--64226787
95
3.9
96
96
1
639
28
27
9
34
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64226413--64226787
143
2.6
144
94
2
648
28
27
9
34
1.88
64230103--64230328
40
5.7
40
93
1
382
26
30
22
20
1.99
64230103--64230328
79
2.8
80
93
1
382
26
30
22
20
1.99
64230103--64230328
119
1.9
120
92
0
382
26
30
22
20
1.99
64231600--64231738
37
3.8
37
92
0
235
25
31
19
23
1.98
64231600--64231738
73
1.9
74
93
1
244
25
31
19
23
1.98
64231875--64232354
48
10.1
48
92
3
785
29
27
8
34
1.86
64231875--64232354
185
2.5
188
89
4
732
29
27
8
34
1.86
64231875--64232322
233
1.9
233
94
0
797
29
27
8
34
1.86
64232335--64232376
22
1.9
22
95
0
75
35
26
4
33
1.77
64237247--64237305
28
2.1
28
100
0
118
28
10
27
33
1.89
64240179--64240228
21
2.5
19
77
6
55
18
14
2
66
1.35
64241729--64241782
22
2.5
22
81
6
56
29
16
25
27
1.97
64243637--64243842
40
5.2
40
87
3
276
23
20
29
26
1.99
64243633--64243842
79
2.7
80
88
3
327
23
20
28
26
1.99
64251874--64252057
40
4.6
40
90
2
264
23
21
29
25
1.99
64251867--64252077
80
2.7
80
88
2
311
24
21
27
26
1.99
64254847--64254952
53
2.0
53
98
0
203
32
16
16
35
1.90
64255816--64255858
6
7.0
6
78
5
50
20
4
0
74
1.00
64260908--64260955
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
64260994--64261050
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
64260992--64261054
20
3.2
20
95
0
117
36
12
19
31
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64261108--64261282
24
7.4
24
92
3
284
28
19
21
30
1.98
64261109--64261275
23
7.1
23
91
3
271
27
19
20
31
1.97
64261108--64261275
47
3.6
47
95
2
293
27
19
20
31
1.97
64261490--64261549
31
1.9
31
89
0
93
31
15
26
26
1.95
64277397--64277463
35
1.9
35
84
0
89
25
20
20
32
1.97
64277969--64278018
17
3.1
16
80
8
66
26
10
14
50
1.73
64281274--64281500
40
5.6
39
88
6
212
25
25
20
27
1.99
64281311--64281500
40
4.7
41
88
8
259
25
25
20
28
1.99
64281302--64281500
81
2.5
80
87
8
271
25
25
20
28
1.99
64284805--64284857
26
2.0
25
85
7
70
49
1
3
45
1.31
64286369--64286412
22
2.0
22
100
0
88
27
18
4
50
1.66
64288482--64288800
101
3.0
109
89
7
528
36
7
16
40
1.77
64288839--64288933
47
2.0
48
97
2
183
31
13
16
37
1.88
64289218--64289287
28
2.5
28
88
4
97
28
12
25
32
1.93
64294063--64294227
48
3.4
48
80
5
165
30
18
22
28
1.97
64294095--64294462
42
8.4
42
72
13
210
27
16
24
30
1.97
64294279--64294462
43
4.4
42
76
11
169
28
15
25
30
1.96
64294257--64294457
85
2.4
85
84
1
269
27
16
25
30
1.97
64297541--64298085
27
20.2
27
86
3
668
26
22
10
40
1.86
64298090--64298203
27
4.2
26
83
8
131
35
17
19
27
1.94
64298098--64298205
54
2.0
55
85
10
152
36
18
19
25
1.95
64298346--64298376
16
1.9
16
93
0
53
29
19
16
35
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64309316--64309374
22
2.7
22
78
0
55
22
25
20
32
1.98
64309729--64309951
6
36.8
6
76
15
201
21
16
13
48
1.81
64309729--64309951
30
7.4
30
86
7
290
21
16
13
48
1.81
64313708--64313932
47
4.8
49
73
13
161
27
18
29
24
1.98
64316041--64316129
44
2.0
45
87
12
130
38
24
5
31
1.79
64316115--64316184
16
4.4
16
85
0
95
32
31
2
32
1.73
64333639--64333737
28
3.5
29
94
5
168
32
27
12
28
1.92
64342724--64342907
67
2.8
65
77
11
191
29
17
30
22
1.97
64352495--64352577
29
2.9
29
98
0
157
28
14
30
26
1.95
64352496--64352590
29
3.2
29
92
3
127
31
15
28
24
1.96
64352491--64352627
60
2.3
58
80
6
143
27
15
32
24
1.95
64363397--64364827
48
29.6
48
87
5
1913
34
7
28
30
1.84
64363537--64363605
34
2.0
34
97
0
129
33
11
28
26
1.91
64363489--64363653
82
2.0
82
98
0
321
33
9
29
27
1.89
64364525--64364559
17
2.1
17
100
0
70
28
11
31
28
1.92
64364429--64364655
113
2.0
113
97
0
427
34
7
28
29
1.84
64364477--64364607
65
2.0
65
100
0
262
33
9
28
29
1.88
64364333--64364751
209
2.0
209
95
0
757
34
7
28
29
1.85
64364968--64365107
37
3.8
37
90
0
226
24
20
30
25
1.98
64364968--64365114
74
2.0
74
93
0
249
24
20
29
25
1.99
64383629--64383660
12
2.7
12
95
0
55
0
28
0
71
0.86
64388921--64389137
40
5.5
40
89
2
287
25
28
23
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64391395--64391464
27
2.6
27
97
2
131
31
27
12
28
1.93
64396692--64396898
53
3.8
54
75
3
193
20
23
16
38
1.93
64399283--64399368
43
2.0
44
93
2
147
47
11
12
27
1.76
64399350--64399399
25
2.0
25
84
7
66
48
4
26
22
1.68
64405716--64405979
138
1.9
138
92
0
447
40
7
7
44
1.60
64424511--64424686
46
3.8
45
78
10
194
21
20
29
28
1.98
64424508--64424679
93
1.8
93
93
0
299
21
20
29
27
1.98
64442027--64442137
33
3.4
33
88
0
168
16
9
34
40
1.80
64443809--64443861
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
64445350--64445453
26
4.0
26
93
0
181
35
24
7
32
1.84
64446147--64446176
12
2.5
12
94
0
51
23
40
30
6
1.80
64447525--64447629
44
2.4
43
80
3
129
12
20
13
54
1.70
64449017--64449041
12
2.1
12
100
0
50
16
8
16
60
1.58
64449566--64449607
21
2.0
20
86
4
57
42
14
7
35
1.73
64449743--64450097
50
7.4
46
79
11
129
29
18
28
23
1.98
64449882--64450114
50
4.7
50
86
4
287
30
18
28
22
1.97
64451369--64451404
18
2.0
18
94
0
63
19
50
8
22
1.74
64457523--64457750
50
4.6
51
81
10
258
28
19
30
22
1.98
64457426--64457750
100
3.3
99
79
10
343
27
20
30
22
1.98
64459764--64460147
76
5.1
74
80
6
340
33
22
20
23
1.97
64459929--64460133
40
5.3
40
70
13
151
35
20
20
23
1.96
64459824--64460146
152
2.1
152
83
2
389
34
21
20
23
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64466174--64466217
18
2.3
18
84
7
52
25
2
6
65
1.28
64469673--64469725
25
2.2
23
83
12
63
30
0
26
43
1.55
64474872--64474924
25
2.2
24
82
3
61
16
22
18
41
1.90
64490312--64490441
40
3.2
40
81
2
163
23
23
28
24
2.00
64498245--64498395
40
3.8
40
79
6
155
26
23
27
22
2.00
64498282--64498411
40
3.2
40
81
2
163
23
23
28
24
2.00
64501185--64501392
40
5.2
40
85
2
258
26
26
21
25
1.99
64505094--64505266
46
3.7
46
79
10
208
21
20
27
29
1.98
64505091--64505261
93
1.8
93
93
0
297
21
21
28
28
1.98
64505491--64505528
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425