Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  380  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116887626--116887664
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2.1
19
100
0
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30
28
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1.96
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9
229
24
22
28
25
2.00
116889855--116890056
40
5.1
38
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13
171
24
22
28
24
2.00
116894676--116894718
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2.0
21
100
0
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32
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6.1
40
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273
24
21
27
26
1.99
116898001--116898243
79
3.1
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81
7
273
24
21
27
26
1.99
116903217--116903382
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3.6
46
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175
30
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20
21
1.98
116903216--116903386
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1.8
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29
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21
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17
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2.7
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2
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18
19
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2.5
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15
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2.1
12
100
0
50
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8
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1.9
30
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0
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3
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13
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1
26
1.12
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15
4.9
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7
81
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0
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1.15
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116928458--116928513
22
2.5
22
80
8
60
78
1
10
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1.03
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20
7.0
20
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17
53
68
2
4
25
1.19
116928513--116928550
18
2.1
19
85
5
51
71
0
2
26
1.00
116928589--116928635
22
2.1
22
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2
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25
0.96
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0
189
32
7
24
36
1.83
116937466--116937518
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116945944--116945978
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1.9
18
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8
34
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116949787--116949899
57
2.0
57
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3
183
23
22
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15
1.93
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26
5.2
26
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0
218
36
23
5
34
1.77
116960077--116960212
52
2.6
52
95
0
245
36
23
5
34
1.77
116960759--116960809
22
2.4
21
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9
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27
23
3
45
1.70
116960939--116961061
37
3.1
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10
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17
30
1.95
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0
24
0
75
0.80
116961941--116961981
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3.2
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90
10
64
0
24
0
75
0.80
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0
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0
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0
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53
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37
1.91
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2.6
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2
1
41
1.20
116973175--116973221
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2.5
19
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4
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1.39
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100
0
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66
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100
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0
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1.9
45
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0
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16
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27
1.97
116977884--116978010
51
2.5
52
80
7
152
44
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14
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1.74
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2
100
0
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0
0
50
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1.9
20
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1.60
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3.3
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82
14
53
70
4
0
25
1.04
117000223--117000267
13
3.5
13
82
11
58
71
4
0
24
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117000354--117000400
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9
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0
0
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0.93
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2.2
38
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120
58
6
4
30
1.45
117003496--117003548
16
3.5
15
77
7
54
49
1
0
49
1.12
117006245--117006287
18
2.3
19
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52
53
0
4
41
1.21
117007345--117007429
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3.0
28
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19
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15
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16
34
1.90
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2.2
56
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2
219
13
33
16
36
1.87
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2.0
30
100
0
122
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48
1.45
117015100--117015165
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1
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2.1
33
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1.74
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2.0
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23
1.96
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1.9
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11
119
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1.26
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0
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18
22
1.97
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48
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48
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2
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0
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0
0
50
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Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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(0-2)
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447
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56
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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(0-2)
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0
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24
12
32
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425