Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  4  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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30
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50
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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55
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1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
1230098--1230406
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6
5.3
6
86
13
50
64
0
20
14
1.28
1233632--1233667
18
2.0
18
94
0
63
38
0
2
58
1.13
1236108--1236164
30
1.9
30
100
0
114
14
42
28
15
1.86
1236920--1237135
46
4.7
46
90
1
308
21
23
14
39
1.91
1236920--1237184
92
3.0
92
86
5
341
22
23
14
39
1.91
1237098--1237173
38
2.0
38
97
0
143
22
26
17
34
1.96
1239322--1239373
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
1244452--1244476
12
2.1
12
100
0
50
24
20
32
24
1.98
1245411--1245445
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
1245788--1245901
61
1.9
60
85
8
160
24
12
13
50
1.75
1246565--1246646
30
2.6
31
80
5
94
48
14
15
20
1.80
1249309--1249344
18
1.9
18
88
5
54
22
0
5
72
1.05
1251556--1251615
26
2.4
24
83
8
75
68
3
0
28
1.05
1251586--1251644
21
2.8
22
85
7
70
69
6
0
23
1.12
1251691--1251723
15
2.1
16
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11
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69
0
0
30
0.88
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22
1.9
22
100
0
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50
0
2
47
1.14
1264723--1264772
23
2.2
23
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0
100
64
8
8
20
1.46
1265926--1266425
63
9.1
55
69
23
245
29
9
33
28
1.89
1265943--1266034
45
2.0
45
91
0
148
23
9
34
31
1.88
1265912--1266310
108
3.7
108
96
0
735
28
9
34
28
1.88
1266051--1266142
45
2.0
45
87
4
132
23
11
33
30
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1266159--1266250
45
2.0
45
91
0
148
23
11
34
29
1.91
1266263--1266476
57
3.7
57
89
1
304
32
10
28
28
1.90
1269852--1269885
2
17.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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13
2.4
13
100
0
62
16
32
45
6
1.72
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284
2.2
287
80
7
699
37
10
13
38
1.79
1274675--1274709
6
6.0
6
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3
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0
17
0
0.66
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57
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0
303
32
10
28
28
1.91
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105
2.1
105
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265
32
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26
1.93
1276565--1276636
22
3.2
22
78
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74
19
9
4
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1.37
1276597--1276635
11
3.5
11
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0
60
20
7
7
64
1.45
1279892--1279977
21
4.1
21
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0
100
16
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15
2.0
15
100
0
60
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1.75
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26
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25
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2
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1284055--1284082
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
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227
5.2
227
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1528
35
14
15
34
1.88
1287502--1287558
11
5.2
11
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0
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19
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1.31
1287508--1287550
22
2.0
22
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0
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1.40
1287510--1287557
22
2.2
22
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0
60
22
4
6
66
1.32
1299297--1299370
36
2.1
36
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0
139
68
10
17
2
1.30
1299561--1299912
140
2.6
139
90
5
540
33
15
18
32
1.93
1299911--1299939
3
9.7
3
100
0
58
34
0
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0
0.93
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24
2.0
23
84
11
62
16
14
4
64
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1303478--1303507
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
1307688--1307712
9
2.8
9
100
0
50
88
0
0
12
0.53
1310475--1310706
75
3.1
75
89
1
322
30
22
26
21
1.99
1314600--1314638
18
2.2
18
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0
51
38
7
15
38
1.76
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1
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1
100
0
52
0
0
0
100
0.00
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2.0
53
100
0
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11
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2
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2
93
0
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0
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19
0
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0
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1.49
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1.8
95
83
1
229
42
1
15
41
1.56

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425