Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  214  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65414819--65414913
31
3.1
31
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0
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22
15
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65415105--65415247
24
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24
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26
22
22
28
1.99
65415105--65415246
47
3.0
48
90
5
207
26
22
22
28
1.99
65415104--65415247
71
2.0
72
89
4
220
26
22
22
29
1.99
65415298--65415357
20
3.0
20
95
0
111
33
20
10
36
1.86
65415298--65415352
11
5.4
11
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30
20
10
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25
1.9
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0
69
25
16
25
33
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27
12.7
27
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28
1.82
65416681--65417023
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414
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22
28
1.82
65416683--65417019
134
2.5
132
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453
40
8
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29
1.82
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2.4
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0
103
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27
6.7
27
88
1
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31
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19
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1.79
65417022--65417232
81
2.6
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83
3
237
31
8
19
40
1.82
65417103--65417270
27
6.3
26
88
2
183
32
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18
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1.77
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3
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100
0
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0
0
0.89
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2.7
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90
0
190
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1.96
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16
2.8
17
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58
19
10
2
67
1.31
65429806--65429857
16
3.2
16
83
8
52
19
9
3
67
1.35
65435776--65436354
49
12.1
49
91
5
945
33
8
27
30
1.87
65435776--65436354
240
2.4
232
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5
964
33
8
27
30
1.87
65436141--65436317
88
2.0
88
96
0
327
33
6
27
32
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65436191--65436268
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2.0
39
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0
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5
28
33
1.79
65436423--65436509
37
2.3
36
92
5
138
20
19
32
27
1.97
65441648--65441730
31
2.7
31
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3
125
28
26
14
30
1.95
65441950--65442019
25
2.8
25
93
0
113
24
22
25
27
2.00
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27
2.9
27
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20
20
21
37
1.95
65442947--65443054
27
3.9
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18
42
1.78
65442996--65443133
27
5.1
27
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29
6
21
42
1.77
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1.9
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19
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1.83
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27
3.4
27
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28
1.82
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2.0
30
100
0
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23
0
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23
2.5
22
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25
0
18
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1.43
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38
2.1
38
92
0
129
25
23
24
26
2.00
65451315--65451362
18
2.6
19
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55
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4
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1.24
65451602--65451641
20
2.0
20
100
0
80
45
5
40
10
1.60
65451604--65451647
20
2.2
20
91
0
70
54
4
31
9
1.52
65463449--65463545
30
3.2
30
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2
97
28
25
15
29
1.96
65466152--65466219
21
3.2
20
80
12
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76
4
16
2
1.07
65466267--65466297
12
2.6
12
100
0
62
45
12
16
25
1.83
65466300--65466324
12
2.1
12
100
0
50
76
0
16
8
1.02
65466294--65466336
18
2.3
18
84
4
50
69
2
18
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1.26
65468574--65468669
30
3.2
29
76
7
104
29
26
15
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65471572--65471612
15
2.7
15
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19
4
58
1.56
65474012--65474183
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3.7
46
73
7
150
23
18
27
31
1.97
65474005--65474175
93
1.8
93
88
0
261
22
19
28
29
1.98
65476229--65476334
28
3.7
27
73
19
81
27
27
18
26
1.98
65476232--65476372
60
2.4
59
83
9
171
28
25
19
26
1.98
65480394--65480557
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2.3
71
100
0
328
18
28
17
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1.94
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71
2.8
70
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258
20
28
17
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1.95
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2.3
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100
0
328
18
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17
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1.94
65487499--65487696
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
65488997--65489052
30
1.9
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12
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30
0
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1.55
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12
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29
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102
28
0
30
41
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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1.93
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1.96
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1.96
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30
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27
17
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27
1.97
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0
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1
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65517347--65517414
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0
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40
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2
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27
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25
1.99
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1.99
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19
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22
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34
23
17
23
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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40
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25
1.99
65542868--65543034
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2.1
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205
25
27
21
25
1.99
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2.5
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1.96
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28
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28
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0
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18
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0
17
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0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65583434--65583487
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28
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0
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0
58
1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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