Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  50  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13403962--13404168
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3.2
66
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240
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13404825--13405286
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2.6
176
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3
489
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1.96
13407965--13408001
2
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0
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0
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0
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0
0
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1.40
13408844--13409150
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145
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1.40
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54
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2
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19
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27
2.3
29
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23
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23
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2.0
21
90
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26
0
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2.0
163
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0
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21
22
16
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1.95
13435430--13435509
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2.8
27
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23
15
32
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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19
1
71
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2.7
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29
19
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1.98
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2.3
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100
0
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1.95
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30
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2.2
27
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1.79
13452532--13452590
18
3.3
18
83
4
66
28
8
18
44
1.79
13455570--13455614
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2.4
19
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10
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2
51
1.26
13455574--13455618
20
2.3
19
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44
2
2
51
1.26
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2.0
30
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0
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5
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55
1.56
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2.2
32
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0
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19
25
34
20
1.96
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20
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51
0
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1.48
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2.8
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26
24
2.00
13486698--13486922
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5.7
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273
25
22
27
24
2.00
13486699--13486922
119
1.9
120
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8
287
25
22
27
24
2.00
13486705--13486955
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3.2
78
79
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246
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1.99
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3.3
10
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0
57
39
6
42
12
1.67
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21
29
1.97
13525784--13525900
53
2.2
53
89
6
173
27
34
20
17
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13535348--13535398
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2.1
24
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24
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31
1.97
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2.7
45
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153
26
29
17
27
1.97
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2.1
16
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0
50
35
20
2
41
1.68
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2.3
19
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18
20
1.96
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171
22
29
19
28
1.98
13574776--13575087
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48
72
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195
22
29
19
28
1.98
13586939--13587002
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3.4
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74
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1.91
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1.25
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60
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Indices
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Percent
Indels
Score
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G
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0
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
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Percent
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40
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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8
213
36
13
11
37
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425