Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  372  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114641369--114641409
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3.5
11
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56
0
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1.41
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2.0
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20
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1.92
114644229--114644338
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4.2
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0
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2.1
44
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2.1
48
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0
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2.1
30
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2.0
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16
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52
55
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1
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1.10
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2.0
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100
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24
24
2.00
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2.0
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50
2.6
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1
179
29
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1.97
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4.0
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34
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16
23
1.96
114696728--114696806
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2.1
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18
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24
15
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2
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0
50
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0
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2.0
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56
0
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35
1.28
114699515--114699569
27
2.1
26
86
3
74
58
1
5
34
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
18
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114705113--114705163
26
2.0
26
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0
102
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5
11
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2.3
18
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0
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21
28
7
42
1.79
114709323--114709412
27
3.3
27
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112
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21
18
1.91
114709320--114709429
54
2.0
54
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159
39
20
22
18
1.93
114709324--114709429
27
3.9
27
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7
99
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20
22
18
1.94
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2.3
24
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19
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1.74
114710835--114710898
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2.6
25
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5
85
17
42
4
35
1.70
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1.8
126
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1.96
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50
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20.5
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0
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0
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8
8
41
1.67
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2
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51
0
0
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1.00
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2
20.0
2
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5
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0
0
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1.00
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0
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60
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39
0
0.96
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59
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224
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42
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5
191
42
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1.81
114723723--114723755
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16.5
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0
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51
0
0
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1.00
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181
45
18
11
24
1.82
114724830--114724937
48
2.3
47
86
1
153
46
18
10
25
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114724992--114725117
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21.0
6
89
0
180
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15
3
19
1.48
114725129--114725187
12
4.9
12
89
0
82
57
10
10
22
1.61
114725129--114725187
24
2.5
24
88
0
91
57
10
10
22
1.61
114725638--114725677
21
1.9
21
94
0
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27
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15
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1.96
114728656--114728695
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0
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1.61
114732578--114732613
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2.8
14
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16
51
27
25
0
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1.52
114732565--114732605
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0
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0
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100
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0
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0
0
50
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2.1
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0
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17
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8
60
1.56
114742232--114742268
2
18.5
2
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0
0
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2.8
24
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18
70
40
4
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46
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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13
36
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9
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1.79
114757184--114757252
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1.79
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2
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1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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1.98
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1.98
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20
23
32
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.8
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1.96
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73
14
509
32
18
16
32
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425