Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  26  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6704644--6704700
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21
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0
1.00
6705287--6705317
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0
0
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21
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0
62
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1.40
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2.7
28
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0
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28
1.40
6733988--6734261
133
2.1
133
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0
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29
1.97
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178
4.2
178
87
1
985
28
21
18
31
1.97
6734982--6735006
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2.1
12
100
0
50
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19
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5
51
2
34
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3
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66
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1.40
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25
2.7
25
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60
0
10
28
1.29
6746765--6746840
28
2.7
28
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4
109
59
3
7
28
1.44
6749689--6749787
50
2.0
50
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1.9
18
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0
61
0
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0
54
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6755083--6755153
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2.2
33
100
0
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5
16
33
1.72
6766751--6766811
30
2.0
30
96
0
113
50
4
0
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1.23
6766763--6766813
16
3.3
16
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10
52
54
1
0
43
1.11
6782197--6782277
40
2.0
40
100
0
162
41
9
14
33
1.79
6789182--6789224
19
2.3
19
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61
76
0
11
11
1.02
6790132--6790168
6
6.2
6
93
0
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18
13
16
51
1.76
6790134--6790169
18
2.0
18
100
0
72
16
11
16
55
1.68
6791465--6791497
11
2.7
13
81
18
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6
15
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1.34
6794800--6794896
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39
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275
40
18
8
32
1.81
6804109--6804151
10
4.2
10
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3
50
69
0
4
25
1.07
6804104--6804172
20
3.4
20
72
13
61
65
0
5
28
1.16
6804108--6804173
31
2.2
30
78
10
64
66
0
6
27
1.15
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20
3.0
19
73
19
57
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1
8
24
1.30
6804406--6804450
20
2.2
21
88
11
67
28
2
4
64
1.25
6804408--6804458
20
2.7
20
85
11
63
29
1
3
64
1.22
6804486--6804547
25
2.6
23
78
16
63
22
0
3
74
0.96
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2.3
11
100
0
50
0
8
0
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0.40
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12
3.0
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7
51
26
0
10
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46
10.8
46
90
1
683
21
23
14
40
1.90
6809668--6810166
185
2.7
185
92
1
788
21
23
14
40
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6812546--6812629
31
2.7
31
90
0
132
26
17
27
28
1.98
6812651--6812803
47
3.2
49
81
12
151
29
15
25
30
1.95
6812698--6812803
46
2.2
46
86
8
142
29
14
27
29
1.95
6822597--6822701
43
2.4
43
85
0
147
37
24
12
25
1.91
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48
2.0
48
100
0
196
35
25
14
24
1.93
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18
2.4
18
92
4
68
38
0
19
42
1.51
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18
2.1
18
94
0
65
27
13
21
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1.91
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2.0
115
100
0
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20
16
32
1.95
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12
2.3
13
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5
51
0
10
58
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1.31
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2
18.5
2
100
0
74
0
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0
51
1.00
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0
0
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0
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20
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0
0
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2.1
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2
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10
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17
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0
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12
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1.81
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22
1.9
23
85
4
61
6
4
11
76
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6854992--6855033
20
2.2
20
79
16
52
40
2
0
57
1.12
6854997--6855043
20
2.3
20
81
0
58
51
2
0
46
1.13
6857261--6857318
26
2.2
26
81
6
64
27
0
3
68
1.05
6859427--6859496
34
2.1
34
100
0
140
25
17
28
28
1.97
6862902--6862934
14
2.3
15
90
10
52
3
12
0
84
0.72
6866098--6866219
40
3.0
40
97
0
226
22
21
9
46
1.79
6876411--6876473
30
2.1
30
81
0
72
23
14
6
55
1.62
6882354--6882406
20
2.7
20
85
8
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37
0
5
56
1.23
6884565--6884712
23
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23
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9
156
14
27
24
33
1.94
6884553--6884704
71
2.1
72
86
3
209
16
28
23
32
1.96
6884565--6884680
48
2.4
49
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9
125
15
28
24
31
1.95
6886632--6886752
42
2.8
43
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9
131
28
25
19
26
1.99
6886632--6886790
85
1.9
85
82
5
205
27
25
20
26
1.99
6888729--6888957
86
2.7
86
78
1
217
34
20
15
29
1.94
6893585--6893812
79
2.9
78
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2
314
32
15
21
30
1.94
6895567--6895603
20
1.9
20
94
5
67
81
0
10
8
0.89
6895574--6895621
23
2.0
23
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11
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0
12
10
1.00
6896986--6897101
57
2.1
56
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1
196
38
11
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1.72
6898059--6898110
26
2.0
27
92
3
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53
1
5
38
1.36
6899042--6899111
31
2.2
32
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12
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25
4
1
68
1.16
6900446--6900481
3
12.0
3
100
0
72
0
33
0
66
0.92
6903685--6903740
29
1.9
29
85
0
76
46
3
8
41
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6907355--6907414
10
5.4
11
79
15
52
55
6
1
36
1.36
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3
18.0
3
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17
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62
5
0
32
1.18
6907498--6907553
12
4.7
13
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18
59
62
5
0
32
1.18
6908106--6908198
13
7.9
12
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23
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15
0
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1.46
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15
0
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1.45
6913480--6913710
41
5.7
41
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1
358
19
23
28
28
1.98
6913480--6913720
122
2.0
123
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369
19
23
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28
1.98
6913480--6913748
122
2.2
123
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366
20
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1.98
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1
203
20
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29
1.98
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2.0
17
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1.73
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42
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28
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15
26
1.96
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31
4.8
31
89
0
226
26
27
18
26
1.98
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24
22
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1.94
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2.2
30
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5
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2
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0
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0
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21
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2
0
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23
2.0
24
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11
2.3
11
100
0
50
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0
0
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31
2.0
31
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3
39
1.33
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61
2.2
60
81
1
143
40
13
4
40
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6947477--6947522
23
2.0
23
82
0
56
26
2
10
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1.41
6947563--6947606
20
2.2
20
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8
54
38
6
0
54
1.27
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17
3.5
17
79
2
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32
3
0
63
1.10
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19
2.4
19
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0
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32
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1.58
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171
2.2
173
84
2
499
31
13
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2.1
28
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9
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8
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20
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24
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2
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2.8
33
82
6
107
22
34
21
22
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425