Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  268  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82368496--82368568
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2.7
27
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0
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24
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324
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1.99
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314
26
27
23
22
1.99
82391535--82391692
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18
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0
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1.9
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1.94
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1.93
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40
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27
21
2.00
82426196--82426378
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4.6
40
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9
205
25
27
22
24
2.00
82426196--82426377
39
4.6
39
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28
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1.99
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105
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3
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1.51
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16
2.0
17
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3
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18
1.28
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2.3
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2
151
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18
32
1.95
82434100--82434217
24
4.8
24
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5
103
19
29
19
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1.96
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25
2.9
25
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65
22
25
21
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1.98
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3.9
53
77
9
210
35
16
25
22
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82443255--82443509
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1.95
82443265--82443462
108
1.8
110
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312
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17
26
23
1.96
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25
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2.1
46
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21
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0
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82450295--82450350
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28
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2.0
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2.0
30
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2.6
27
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24
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100
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10
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2.1
25
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29
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21
1.98
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46
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10
187
29
28
20
21
1.98
82501838--82501981
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47
72
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131
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27
19
22
1.98
82506705--82507709
48
21.0
48
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0
1629
35
6
26
31
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82507754--82507950
37
5.3
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24
20
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22
1.98
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7.8
40
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19
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27
1.99
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48
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27
31
1.82
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3.3
37
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219
25
19
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1.98
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2.0
38
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1.83
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1.87
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19
2.1
19
86
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60
20
0
20
1.37
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20
29
25
1.99
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2.5
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29
20
23
1.99
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141
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27
21
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1.99
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18
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17
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1.94
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0
5
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0.93
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20
3.8
21
76
15
67
78
0
6
15
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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42
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1.96
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1.95
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9
38
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18
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1.66
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1.98
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2.2
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420
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1.98
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1.98
82606345--82606617
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1.98
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0
25
3
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.95
82643300--82643414
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1.98
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20
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16
10
33
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82696224--82696352
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24
1.96
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2.4
80
77
5
184
24
22
29
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425