Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  17  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
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1
0
59
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
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1.95
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26
4.2
26
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0
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19
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7
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3.2
27
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2.5
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2.0
13
100
0
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23
1.92
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2.2
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5
53
50
0
3
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20
1.9
20
94
0
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39
10
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20
2.0
20
84
0
51
46
20
2
30
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.2
26
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1.79
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2.0
35
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20
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25
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1.89
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3.0
38
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24
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19
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12
56
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4665904--4665947
20
2.2
20
84
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15
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1.65
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20
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20
75
0
61
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5
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28
1.72
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23
2.0
22
84
12
58
60
8
4
26
1.44
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31
2.3
31
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7
81
38
2
8
50
1.48
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23
2.0
23
87
8
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46
2
2
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1.26
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28
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27
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1
1
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2
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0
0
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1.00
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26
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10
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2
0
41
1.14
4691424--4691496
9
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8
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16
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2
0
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1.14
4691424--4691496
27
2.8
26
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2
0
41
1.14
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181
2.1
181
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26
26
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26
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19
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19
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2.0
22
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22
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16
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26
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0
100
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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37
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1.36
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0
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0
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0
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0
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0
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25
30
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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3
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2.0
21
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0
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19
29
21
29
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425