Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  20  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5304847--5304889
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2
0
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2.9
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0
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11
76
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1
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19
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5313023--5313113
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132
37
15
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37
1.81
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3.8
207
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0
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30
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21
22
31
1.98
5314299--5314589
83
3.4
84
84
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406
23
21
22
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0
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1
11
0
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43
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7
140
30
20
25
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5328254--5328451
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2.2
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89
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303
30
20
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25
1.99
5328305--5328449
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3.2
45
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19
24
24
1.97
5328506--5328623
46
2.6
46
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2
132
31
24
20
23
1.98
5328543--5328668
46
2.8
46
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1
155
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22
17
26
1.96
5330047--5330103
23
2.4
24
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5
1
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2
0
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21
1.9
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2
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1.14
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14
2.5
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13
52
42
0
5
51
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21
2.9
22
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9
76
36
0
7
55
1.29
5374364--5374777
44
9.4
45
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10
232
35
21
22
20
1.96
5374189--5374791
264
2.3
260
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6
702
34
20
23
21
1.96
5374188--5374815
87
7.2
86
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5
570
34
21
23
20
1.97
5379265--5379309
22
2.0
23
91
4
74
42
20
17
20
1.90
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28
3.6
24
81
13
93
46
33
4
15
1.66
5379514--5379597
28
3.0
28
91
1
132
46
30
3
19
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6
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54
3.0
54
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2
238
18
24
22
35
1.96
5385423--5385581
27
5.9
27
82
11
175
18
23
22
35
1.96
5385423--5385581
81
2.0
80
83
10
200
18
23
22
35
1.96
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2.1
39
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0
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19
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0
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5
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1.25
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22
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0
7
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0
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157
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1.79
5401107--5401203
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2.0
49
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167
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73
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5407102--5407159
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3
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32
0.91
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3
111.7
3
78
7
308
29
6
1
62
1.30
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18
2.2
18
85
0
51
15
5
2
76
1.06
5410379--5410424
5
9.4
5
80
4
58
39
23
2
34
1.67
5410373--5410417
15
3.0
15
87
6
56
35
24
4
35
1.76
5410375--5410428
10
5.5
10
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8
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38
25
1
33
1.67
5412757--5412930
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93
90
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29
29
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13
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21
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0
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10
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20
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19
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58
34
34
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5428197--5428234
18
2.1
19
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34
2
31
31
1.72
5431708--5432175
143
3.3
142
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19
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26
1.98
5433643--5433673
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100
0
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32
0
35
1.58
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79
3
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30
6
1
61
1.30
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18
2.2
18
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0
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15
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2.0
145
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0
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2.3
13
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0
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30
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28
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1
0
60
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33
2
0
64
1.06
5456107--5456181
23
3.3
23
75
14
75
36
1
0
62
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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8
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2
0
60
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21
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3.2
210
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3.1
206
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2.0
24
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2.0
81
100
0
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0
0
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2.3
19
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0
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0
0
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24
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7
79
60
10
10
19
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5489469--5489550
24
3.4
24
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6
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59
13
8
18
1.58
5489461--5489557
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48
100
0
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136
3.1
136
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0
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0
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3.1
135
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0
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0
0
50
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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