Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  384  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118135326--118135394
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2.6
26
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1.17
118135346--118135403
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0
1
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0.89
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0
111
10
0
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22
2.9
22
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0
117
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0
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1.25
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2.9
15
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3
54
6
4
37
51
1.49
118144661--118144705
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2.0
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1.8
138
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2
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100
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2.2
12
100
0
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18
1.94
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21
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12.3
12
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24
10
12
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1.71
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42
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25
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42
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3.4
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1
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9
4
38
47
1.57
118164710--118164756
21
2.2
21
88
0
67
38
38
14
8
1.77
118165243--118165277
18
1.9
18
88
0
52
34
2
31
31
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
17
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0
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1.05
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22
2.5
22
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9
65
53
0
3
42
1.18
118168573--118168635
21
2.9
21
81
11
65
50
0
3
46
1.17
118168607--118168674
30
2.3
30
87
10
95
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2
52
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50
0
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0
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2.2
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244
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20
30
1.97
118184908--118184953
18
2.5
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16
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28
9
0
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1.27
118185126--118185168
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2.0
20
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25
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2
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1.37
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2.0
21
82
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6
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1.41
118185425--118185469
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17
15
2
64
1.39
118185416--118185469
27
2.1
24
90
10
81
14
12
3
68
1.34
118185462--118185525
21
2.9
21
78
21
69
28
6
0
65
1.16
118185510--118185839
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14.2
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23
112
24
13
0
60
1.37
118185531--118185978
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18.4
27
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320
24
13
0
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1.36
118185459--118185962
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10.5
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10
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25
12
0
61
1.34
118185459--118185961
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5.3
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90
5
734
25
12
0
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1.34
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7.5
74
73
14
416
24
12
0
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1.35
118186431--118186701
133
2.0
133
95
0
497
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23
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31
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2.0
17
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50
51
6
0
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1.26
118190891--118190922
5
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5
92
7
57
81
0
0
18
0.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118190892--118190922
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0
0
19
0.71
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5
6.6
5
92
7
57
81
0
0
18
0.70
118195346--118195376
9
3.3
9
95
4
53
80
0
0
19
0.71
118198923--118198987
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2.0
32
100
0
130
30
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24
38
1.80
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2.0
26
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22
15
24
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2.9
18
71
28
52
60
2
0
37
1.09
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0
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0
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100
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0
33
33
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20
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62
59
2
0
38
1.09
118211560--118211611
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0
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1
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1.9
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62
5
3
28
1.32
118211860--118212004
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1
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1.24
118211860--118212002
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51
51
0
3
44
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31
2.0
31
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6
92
50
0
6
42
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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46
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2
10
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3.3
15
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0
0
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1.00
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28
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1.97
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1.71
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14
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0
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0
0
56
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.98
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1.98
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2.1
132
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28
1.97
118345287--118345318
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2.7
12
95
0
55
25
3
6
65
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118346640--118346694
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3
1.22
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16
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0
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1.97
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11
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1.9
96
92
0
304
27
26
17
28
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425