Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  334  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103703178--103703228
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2.2
23
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0
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1
5
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3.4
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1.32
103705069--103705124
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2.0
28
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0
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85
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2.3
24
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2
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32
5
1
60
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103730617--103730789
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3.7
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23
28
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2.00
103747574--103747766
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79
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30
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1.94
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21
2.0
21
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51
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84
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29.8
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21
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3
37
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103777110--103777432
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30
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3
37
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103777146--103777194
16
2.9
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6
71
44
18
0
36
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103777166--103777321
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3.3
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222
45
14
3
35
1.64
103777106--103777478
81
4.7
80
83
10
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3
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103777418--103777509
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1
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1.53
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2.1
24
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0
0
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23
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1.98
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2.0
64
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21
1.86
103794113--103794154
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2.2
19
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20
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1.53
103794220--103794448
3
76.7
3
72
13
143
62
2
6
29
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103794851--103794931
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1.41
103794855--103794938
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3.2
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23
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1
51
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1.40
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43.5
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3.2
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2
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12
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12
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82
0
5
11
0.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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0
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1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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0
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27
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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28
4
0
67
1.09

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425