Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  364  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112294921--112295184
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5.7
48
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17
29
25
1.98
112294918--112295183
47
5.7
46
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11
177
27
17
29
25
1.98
112296014--112296078
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2.2
30
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0
85
23
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1.99
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19
2.2
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25
1.23
112296952--112297023
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3.0
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85
6
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75
5
18
1
1.07
112297938--112298047
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5
0
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0
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2.0
225
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0
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0
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0
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1.37
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2.1
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5
53
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3
6
54
1.42
112351199--112351232
14
2.4
14
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14
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0
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6.0
46
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1
417
38
14
23
22
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112357734--112358008
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3.0
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2
417
38
14
23
22
1.92
112357734--112358008
139
2.0
138
89
2
417
38
14
23
22
1.92
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2.0
25
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0
100
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0
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2
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0
0
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52
35
0
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39
0
2
58
1.10
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14
84
2
62
78
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10
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1.06
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2.3
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83
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13
5
1.12
112426497--112426727
73
3.2
72
82
3
309
29
17
20
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
16
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4.0
90
86
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466
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16
20
35
1.94
112426816--112427091
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3.8
73
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11
323
26
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23
34
1.95
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2.9
125
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6
455
27
16
22
34
1.95
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1.9
14
100
0
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25
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1.68
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71
15
242
27
15
23
32
1.95
112427596--112427781
73
2.5
73
92
1
302
29
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31
1.96
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2.5
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20
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1.8
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251
27
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14
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26
17
28
28
1.98
112462336--112462388
28
1.9
28
84
3
72
28
18
26
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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20.0
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1.83
112478983--112479149
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1.83
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0
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6.0
43
93
0
417
22
29
21
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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129
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1.99
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2.2
19
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1.20
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24
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1.94
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23
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23
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1.97
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3.2
44
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18
116
25
25
17
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
175
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497
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23
19
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1.97
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23
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0
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1.24
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2.7
17
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9
60
29
4
0
66
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425