Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  408  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
124407512--124407542
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2.6
12
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0
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54
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0
1.42
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2.1
46
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0
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18
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16
2.9
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8
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4
0
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1.20
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2.6
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0
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0
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0
0
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2.0
426
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2.0
99
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19
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38
1.91
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20
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3
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2.0
33
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0
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8
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1.9
25
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16
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3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86
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11
5.4
11
70
16
55
38
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20
30
1.87
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24
5.0
24
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5
170
28
21
22
26
1.99
124446834--124446952
47
2.5
48
89
5
170
28
21
22
26
1.99
124447144--124447206
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2.1
31
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1.91
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48
2.1
48
98
0
189
45
20
12
22
1.83
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46
87
7
392
22
23
14
39
1.91
124450148--124450223
38
2.0
38
100
0
152
21
26
18
34
1.96
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4.7
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63
3
0
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2.8
177
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0
781
28
19
22
28
1.98
124479248--124479289
22
1.9
22
85
9
59
35
0
14
50
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
21
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0
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4
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40
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124486057--124486289
12
19.2
12
68
18
103
32
1
2
63
1.16
124486106--124486278
29
6.2
29
71
18
93
31
1
0
65
1.07
124486109--124486276
7
22.1
7
68
21
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30
1
0
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1.9
18
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17
0
8
74
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2.1
16
94
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60
0
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3
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2.8
53
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90
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16
25
26
1.96
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225
2.8
225
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31
16
25
27
1.96
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3.1
135
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0
640
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16
25
26
1.96
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45
13.2
45
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10
377
31
16
25
26
1.96
124503007--124503060
25
2.2
25
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6
74
31
1
1
64
1.14
124503090--124503254
12
14.1
12
70
22
93
32
1
1
64
1.12
124503092--124503244
21
7.3
21
70
22
85
32
1
0
65
1.09
124503091--124503222
43
3.3
40
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13
114
31
2
0
65
1.11
124503181--124503259
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3.0
28
82
10
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32
1
1
64
1.09
124503626--124503660
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1.9
18
94
0
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20
0
5
74
1.02
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18
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14
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58
4
24
12
1.53
124522865--124522900
18
2.0
18
100
0
72
55
5
27
11
1.57
124523572--124523624
13
4.1
13
85
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28
7
28
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0
0
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1.00
124534958--124535074
59
2.0
59
84
0
153
28
17
9
45
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
124543697--124543738
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2.3
18
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68
76
2
11
9
1.12
124544779--124544818
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1.9
21
89
0
62
55
2
7
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1.42
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3.0
105
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317
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12
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30
1.90
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2
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2
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0
0
50
1.00
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23
1.11
124571778--124571844
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2.0
33
100
0
134
23
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1.94
124575716--124575766
26
2.0
26
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0
0
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19
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0
0
50
1.00
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0
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0
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0
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2
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6
52
44
0
0
55
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10
157
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9
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1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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0
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16
16
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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258
20
28
17
33
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425