Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  322  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100354284--100354339
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24
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3.4
221
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1.92
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3.9
75
86
3
346
32
16
19
32
1.94
100366753--100366998
74
3.3
73
88
3
348
34
15
18
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1.92
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246
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0
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45
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0
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0
0
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1.00
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0
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1
41
1.22
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0
0
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3.1
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17
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1.97
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22
22
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22
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21
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1.95
100375323--100375409
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2.0
44
84
2
113
24
18
19
37
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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0
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61
2
5
30
1.31
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2.5
24
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63
54
3
4
37
1.38
100386240--100386271
2
17.0
2
87
12
50
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0
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1.00
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25
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23
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1.10
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76
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1.09
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2.4
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53
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2
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34
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4
58
1.32
100390998--100391110
20
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63
37
0
3
58
1.21
100391228--100391287
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1
3
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1.19
100391228--100391280
20
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19
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63
30
0
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0
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25
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1.77
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4.0
27
84
9
130
18
24
21
36
1.95
100400919--100401029
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2.1
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152
18
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21
36
1.94
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2.0
96
100
0
390
30
11
16
41
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100407025--100407145
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4.8
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125
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23
19
1.95
100407025--100407146
50
2.4
50
83
0
145
36
21
23
18
1.95
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19
2.6
21
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22
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50
13
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32
1.59
100409886--100409917
2
15.5
2
93
6
55
50
3
0
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1.17
100417060--100417103
18
2.5
17
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15
43
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13
1.85
100418642--100418677
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2.3
16
90
4
56
75
8
11
5
1.19
100420697--100420738
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2.8
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85
7
59
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0
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0
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52
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0
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1.80
100438274--100438371
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144
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36
1.80
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12
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0
55
90
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9
0
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187
25
18
25
30
1.98
100469743--100469790
16
3.1
16
69
6
53
43
14
2
39
1.57
100469730--100469790
31
2.0
31
100
0
122
42
14
3
39
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100469730--100469780
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3.3
15
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5
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3
35
1.68
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2.2
37
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0
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20
1.80
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1.82
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21
2.0
21
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0
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21
1.9
20
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14
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1
1
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1.11
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37
2.9
37
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3
3
34
1.34
100482162--100482228
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2.6
24
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1
1
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2.2
20
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1.98
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2
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0
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0
0
0.00
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2.0
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1.75
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2.0
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0
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1.79
100506755--100506836
32
2.6
31
84
11
87
40
21
4
32
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100507283--100507593
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46
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22
23
15
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1.91
100507283--100507590
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3.5
91
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22
23
14
39
1.91
100507283--100507593
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417
22
23
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1.91
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0
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24
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0
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1.96
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0
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0
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0
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31
1
0
65
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100542639--100542965
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132
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132
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18
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28
1.98
100542493--100543556
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264
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2.0
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1.98
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152
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1.98
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2.0
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130
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5
593
28
18
18
34
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425