Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  349  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107916500--107916664
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2.4
70
94
3
298
29
21
20
28
1.98
107916714--107916777
20
3.3
20
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6
89
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20
10
34
1.88
107916722--107916783
18
3.3
18
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4
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19
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1.81
107920027--107920074
25
1.9
25
87
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107920191--107920242
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2.1
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36
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23
13
1.92
107920226--107920346
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1.9
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154
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18
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2.0
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27
18
25
1.98
107949574--107949757
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296
28
27
18
25
1.98
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2.5
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14
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0
30
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4
32
1.30
107954074--107954129
10
5.4
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83
10
60
60
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68
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13
1.36
107962604--107962671
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2.2
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10
88
23
8
20
47
1.78
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10
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55
57
1
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36
1.26
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20
4.4
20
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8
74
55
1
6
36
1.33
107965011--107965057
20
2.3
20
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59
0
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34
1.23
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60
0
0
40
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26
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161
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17
34
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107976778--107976887
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2.1
52
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179
38
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17
34
1.83
107978114--107978207
41
2.4
39
78
13
97
51
2
3
43
1.29
107978150--107978228
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2.6
31
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13
83
48
5
2
44
1.38
107979895--107979925
16
1.9
16
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0
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9
9
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1.9
19
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44
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1.96
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1.96
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2.1
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52
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0
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2.3
40
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1
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27
20
23
28
1.99
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40
2.7
40
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160
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21
23
24
1.99
107994273--107994523
132
1.9
132
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366
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1.97
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2.0
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0
0
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1
36
1.36
107996370--107996427
27
2.2
26
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73
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5
32
1.49
107996368--107996427
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2.3
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55
6
5
33
1.48
107996674--107996744
25
2.9
23
78
17
72
53
7
4
35
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107996817--107996858
21
2.0
20
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47
4
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35
1.61
107996950--107997038
3
29.3
3
93
2
151
66
3
0
30
1.08
107998783--107998965
89
2.0
91
81
2
217
39
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16
29
1.88
107998874--107999113
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72
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5
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34
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17
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1.95
107998711--107999335
237
2.6
235
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5
758
34
18
17
29
1.94
107998945--107999276
162
2.0
163
96
0
612
34
19
17
28
1.94
107999118--107999342
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3.1
72
85
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15
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0
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0
0
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6
5
32
1.49
108011954--108012013
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2.3
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5
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1.48
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1.26
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2.5
23
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1.77
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0
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0
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0
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25
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2
6
73
1.16
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24
2.2
24
83
10
63
63
0
11
25
1.28
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22
2.0
22
100
0
88
22
9
4
63
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.92
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21
4.0
23
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1.92
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1.9
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5
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0
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1.30
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2
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0
12
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1.39
108043536--108043620
21
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24
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1.91
108043559--108043608
21
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0
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28
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1.95
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0
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25
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0
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4
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17
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0
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2.0
18
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1.80
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27
3.4
27
82
8
105
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14
31
21
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
108130220--108130277
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27
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0
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24
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2
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20
1.97
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1.97
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1.96
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1.95
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202
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29
1.97
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28
1.98
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83
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1.97
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2.2
19
90
4
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52
17
10
20
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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13
5
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1.65
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1.47
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0
0
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20
19
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18
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2.0
143
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0
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31
17
23
27
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425