Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr08 129432109 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  244  of  425  ( 50925 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
30
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0
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28
1.99
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4.2
40
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2
185
25
27
21
25
1.99
74921048--74921214
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
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2.5
19
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22
53
34
23
17
23
1.96
74929044--74929210
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
74929044--74929210
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
74930032--74930077
17
2.5
19
74
22
53
34
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17
23
1.96
74935729--74935892
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2.3
71
100
0
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2.8
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3
258
20
28
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4.2
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3
172
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27
22
25
2.00
74944063--74944212
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1.9
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205
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2.00
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2.5
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53
34
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17
23
1.96
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40
4.2
40
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2
176
24
27
22
25
2.00
74952042--74952192
80
1.9
79
83
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23
27
22
25
2.00
74953017--74953062
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2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
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2.3
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100
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1.94
74958701--74958898
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2.8
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258
20
28
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1.95
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2.3
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0
319
18
28
17
34
1.94
74966278--74966475
71
2.8
70
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3
267
20
28
17
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1.95
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26
2.0
26
96
0
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5.0
6
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4
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0
0
13
0.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
13
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0
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20
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20
1.97
74993678--74994141
49
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49
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1
732
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30
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31
1.86
74998262--74998400
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2.4
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0
215
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20
17
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1.96
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15
2.5
15
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13
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3.4
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33
1.34
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2.5
23
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0
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53
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1.59
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11
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0
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0
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1.64
75031381--75031434
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2.2
25
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27
5
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18
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2
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28
21
26
24
1.99
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17
2.8
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22
50
24
18
22
34
1.96
75048589--75048758
40
4.3
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10
159
28
21
26
24
1.99
75050654--75050749
40
2.4
39
87
1
138
11
13
27
47
1.77
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45
2.4
45
79
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108
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5
17
29
1.70
75063441--75063611
46
3.7
45
80
12
213
28
28
21
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75063446--75063615
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94
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306
28
28
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21
1.99
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2.6
43
91
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166
22
31
22
22
1.98
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15
2.0
15
93
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34
27
6
31
1.83
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26
3.0
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75
21
68
32
30
11
25
1.91
75075447--75075719
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5.4
50
85
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345
33
26
13
26
1.93
75075433--75075691
25
10.3
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71
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136
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13
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1.93
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3.2
40
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28
24
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25
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3.2
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165
23
28
24
23
2.00
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17
1.56
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3.0
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36
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40
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2
305
25
24
28
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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39
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27
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24
1.99
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27
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24
1.99
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78
2.3
81
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248
25
27
22
24
2.00
75128021--75128223
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247
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27
22
24
2.00
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40
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40
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26
27
21
24
1.99
75131798--75131982
79
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7
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26
27
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24
1.99
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26
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1.99
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101
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2.3
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0
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16
16
40
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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40
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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