Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  28  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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60
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3
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0
0
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7226555--7226615
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19
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2.0
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1.9
38
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114
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15
4
72
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7226577--7226639
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2.5
24
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4
14
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1.12
7226610--7226660
17
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17
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11
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7226555--7226688
62
2.2
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170
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11
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1.20
7226653--7226709
27
2.1
27
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105
12
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5
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7226656--7226708
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15
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14
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22
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2.1
29
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52
52
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1.49
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15
2.5
17
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2
1.37
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13
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0
9
1.34
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3.0
22
93
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116
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53
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1.32
7239045--7239148
35
2.9
36
85
2
122
36
52
0
10
1.36
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206
3.2
206
94
1
1131
29
18
23
28
1.98
7252358--7252403
15
3.0
15
83
3
56
50
36
6
6
1.54
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15
2.5
17
84
7
50
48
43
4
2
1.37
7252488--7252567
13
6.8
13
68
21
59
38
52
1
7
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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1.36
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33
2.3
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101
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1.47
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2.5
51
89
2
206
34
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23
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1.96
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4.8
31
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18
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1.98
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4.6
47
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179
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14
26
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1.95
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201
28
14
27
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1.95
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2.1
19
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18
1.94
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2
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0
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52
36
0
2
61
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7300782--7300825
22
2.0
22
95
0
79
52
11
13
22
1.72
7301691--7301907
46
4.7
46
91
1
310
39
15
24
21
1.91
7301642--7301907
138
2.0
130
86
7
363
38
15
24
21
1.92
7302835--7302890
22
2.5
21
81
16
60
37
0
19
42
1.52
7303710--7303814
36
2.9
36
85
0
129
23
9
22
43
1.82
7304196--7304248
26
2.0
26
100
0
106
18
11
26
43
1.84
7312380--7312433
27
2.0
27
100
0
108
37
14
22
25
1.93
7312382--7312439
27
2.1
27
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0
98
37
17
18
25
1.93
7312394--7312561
85
2.0
81
93
4
282
42
16
13
28
1.85
7319595--7319630
18
1.9
19
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5
56
25
22
0
52
1.47
7319600--7319638
18
2.2
18
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0
51
23
25
0
51
1.49
7322480--7322558
39
2.0
39
97
0
149
7
35
12
44
1.71
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6
6.3
6
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11
60
84
0
2
13
0.73
7324611--7324673
12
5.4
11
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12
54
76
1
4
17
1.04
7326118--7326226
9
11.7
9
71
18
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72
4
5
17
1.21
7326167--7326213
19
2.5
18
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10
58
78
4
2
14
0.99
7326225--7326266
22
2.0
21
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61
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21
1.48
7330945--7330981
9
4.1
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0
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10
10
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1.74
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3.1
15
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3
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73
0
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1.10
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15
2.8
15
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0
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0
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7332168--7332242
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39
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0
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29
14
46
1.76
7332986--7333159
48
3.6
50
76
6
180
29
19
27
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7332983--7333159
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1.8
94
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4
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28
19
27
23
1.99
7333024--7333203
98
1.8
98
81
7
222
29
17
28
23
1.97
7336654--7336693
19
2.0
20
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4
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7
5
30
1.48
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19
3.3
19
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12
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3
4
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1.13
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16
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0
0
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2.0
26
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9
0
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0
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0
0
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1.9
130
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1
353
28
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17
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1.94
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2
20.5
2
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0
0
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38
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7
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2.0
21
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0
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2.0
20
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0
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65
0
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0
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0
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0
0
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20
2.8
20
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5
5
32
1.45
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2
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2
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4
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14
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22
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56
0
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1.25
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33
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103
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1
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157
54
2
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24
2.8
23
83
4
85
52
4
4
38
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7376712--7376765
22
2.5
20
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13
54
53
7
3
35
1.47
7377018--7377078
16
4.0
15
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15
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0
3
26
1.02
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2.0
16
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0
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40
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1.68
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22
2.1
23
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4
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7391694--7392008
144
2.2
145
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420
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1.95
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0
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0
0
24
0.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425