Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  326  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101293639--101293718
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3.0
27
90
0
124
30
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20
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1.82
101293614--101293740
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2.4
54
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141
27
9
19
43
1.82
101293640--101293752
27
4.1
28
82
5
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28
7
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1.80
101293705--101294072
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1.84
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23
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0
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15
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2.6
22
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0
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18
1.89
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2.8
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70
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22
19
1.97
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41
3.0
41
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2
194
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22
20
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6.1
54
76
5
238
29
8
19
41
1.82
101319881--101320272
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4.9
80
78
6
310
30
9
19
40
1.84
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3.7
27
86
0
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31
1.95
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2.0
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130
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27
27
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0
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2.0
34
97
0
129
42
21
8
27
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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26
22
22
1.99
101341240--101341367
30
4.4
30
86
8
165
28
25
13
32
1.93
101341240--101341367
58
2.2
58
85
4
168
28
25
13
32
1.93
101349153--101349282
29
4.5
29
84
9
158
28
25
13
32
1.94
101349153--101349282
30
4.5
30
86
9
171
28
25
13
32
1.94
101357347--101357642
40
7.6
40
92
4
466
28
28
20
22
1.99
101357347--101357642
114
2.5
116
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456
28
28
20
22
1.99
101360124--101360163
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30
20
20
30
1.97
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25
2.9
25
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94
23
25
20
30
1.99
101360207--101360291
25
3.5
24
80
13
93
27
22
21
29
1.99
101360499--101360582
31
2.7
31
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1
143
33
15
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25
1.95
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2.0
21
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1.95
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21
2.0
21
90
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33
19
28
19
1.96
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62
30
20
20
30
1.97
101368157--101368210
24
2.2
24
81
9
65
31
20
18
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1.96
101371292--101371320
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2.6
11
100
0
58
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15
93
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53
29
9
0
61
1.28
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22
26
24
2.00
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2.8
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285
33
17
28
20
1.95
101384735--101384898
71
2.3
71
97
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310
35
17
28
18
1.94
101388113--101388296
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4.6
40
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2
172
28
22
26
22
1.99
101388153--101388341
80
2.4
80
77
5
184
24
22
29
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101392943--101393044
28
3.5
29
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6
109
28
27
14
29
1.95
101400786--101400887
28
3.5
29
81
6
109
28
27
14
29
1.95
101402479--101402623
40
3.6
40
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4
193
23
26
24
25
2.00
101403332--101403365
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2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
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2.1
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0
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23
25
15
35
1.94
101408210--101408376
24
7.0
24
93
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257
26
22
22
28
1.99
101408209--101408376
71
2.3
71
90
4
257
26
22
22
29
1.99
101408426--101408486
20
3.0
20
95
0
113
34
19
9
36
1.85
101408426--101408481
11
5.5
11
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10
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1.9
25
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25
16
25
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1.96
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3.3
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23
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1.81
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9.6
27
87
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282
40
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22
29
1.81
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27
3.7
27
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103
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19
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74
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17
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29
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149
22
27
22
26
1.99
101432790--101432899
39
2.8
39
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4
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23
30
23
22
1.99
101436080--101436145
33
2.0
33
84
0
87
28
22
22
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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19
21
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2.0
19
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19
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1.92
101446308--101446748
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3.9
112
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332
30
15
19
35
1.92
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30
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0
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19
1.84
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2.0
24
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1.98
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25
2.3
25
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17
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1.96
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1.99
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2.0
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26
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1.91
101504407--101504469
28
2.2
28
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5
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26
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28
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1.91
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2.0
23
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0
2
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2.7
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5
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27
32
17
22
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.00
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23
2.00
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2.0
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1.98
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2.2
26
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0
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5
29
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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2.0
210
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0
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26
19
25
29
1.98
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4.3
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10
159
28
21
26
23
1.99
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2.1
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5
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0
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32
1.98
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1
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24
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1.99
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0
208
23
32
21
21
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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