Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  6  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1627359--1627425
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9
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2
0
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1.14
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3
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0
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1627583--1627638
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2.5
24
77
19
66
26
7
0
66
1.18
1627760--1627843
38
2.1
41
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111
35
2
3
58
1.28
1627759--1627854
38
2.5
35
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20
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3
3
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1.29
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3
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32
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1.19
1642725--1642785
22
2.8
22
87
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1
3
62
1.21
1643203--1643239
19
2.0
18
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5
56
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2
2
32
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2.0
23
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2.0
25
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56
0
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39
1.18
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15
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55
56
0
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34
1.32
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52
0
0
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1.00
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1.9
89
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1
2
49
1.22
1667243--1667273
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67
0
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0
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0
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0
0
50
1.00
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0
0
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20
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11
3.7
11
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0
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56
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19
1.66
1672100--1672147
22
2.2
22
84
0
69
60
8
10
20
1.55
1672202--1672396
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5.1
38
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0
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2
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2
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0
58
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0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1675553--1675606
23
2.4
22
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42
5
0
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1.25
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28
2.7
29
79
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93
35
28
10
25
1.89
1683940--1684005
33
2.0
33
100
0
132
51
12
9
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1.69
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19
3.1
19
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1
0
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1.10
1689798--1689859
20
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21
80
19
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43
1
0
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1690919--1690957
15
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15
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2
2
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12
2.2
12
100
0
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7
18
37
1.79
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22
3.7
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1
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22
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1701747--1702203
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5.0
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92
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21
22
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23
2.1
23
100
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4
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2.0
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3
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2.0
26
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28
0
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1.23
1729799--1729832
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2.1
17
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52
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2
11
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2.1
86
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1738738--1738781
20
2.2
20
84
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54
36
2
0
61
1.09
1738736--1738782
15
3.1
15
82
14
53
36
2
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1.08
1739216--1739289
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2.0
37
97
0
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37
13
14
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21
2.2
21
84
0
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10
8
6
74
1.22
1739801--1739840
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2.9
14
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3
64
67
0
0
32
0.91
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2.0
78
97
0
298
33
3
3
59
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1748647--1748705
2
30.5
2
93
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50
0
0
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1.00
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2.0
22
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4
59
64
0
0
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0
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48
0
0
51
1.00
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0
81
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0
2
40
1.11
1757290--1757345
2
29.5
2
78
10
55
44
0
0
55
0.99
1757290--1757344
21
2.7
20
80
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58
45
0
0
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20
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24
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9
60
1.50
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2
0
65
1.14
1758028--1758116
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23
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1
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1.37
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17
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68
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0
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1.13
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19
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2
29
1.29
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13
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5
25
1.36
1761621--1761685
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1.12
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24
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0
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0
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11.3
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100
0
68
67
0
0
32
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1770019--1770074
23
2.5
22
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16
1
8
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1.17
1770019--1770066
11
4.3
11
94
5
87
16
2
8
72
1.18
1770019--1770083
34
1.9
34
84
6
87
21
1
7
69
1.22
1770449--1770519
35
2.0
35
94
0
124
25
9
46
18
1.79
1770831--1770929
44
2.2
44
80
3
101
29
15
17
38
1.90
1771323--1772305
72
12.8
72
72
16
608
33
19
17
28
1.95
1771581--1771609
14
2.1
14
100
0
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13
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14
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14
100
0
58
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13
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1771435--1772306
163
5.6
158
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12
817
34
19
17
28
1.95
1771758--1772472
72
9.2
73
77
15
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33
20
17
28
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1772129--1772157
14
2.1
14
100
0
58
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6
13
13
1.45
1771984--1772546
163
3.5
163
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2
933
33
20
17
28
1.96
1772459--1772487
14
2.1
14
100
0
58
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6
13
13
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1771219--1772473
548
2.3
540
94
2
1988
33
19
17
29
1.95
1787288--1787340
15
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16
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1
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28
1.38
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3
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0
0
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0
2
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54
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2.5
23
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15
3
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72
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1788188--1788237
12
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12
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2
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8
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1.24
1788625--1788695
35
2.0
35
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0
124
25
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18
1.79
1789708--1789747
19
2.0
22
85
14
59
32
47
2
17
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1789808--1789947
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5.2
28
90
5
184
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22
24
17
1.96
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26
2.8
27
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100
31
13
21
34
1.91
1791566--1791649
26
3.2
26
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0
150
35
23
5
34
1.80
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27
2.0
27
100
0
110
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34
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49
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4.1
109
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39
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35
1.76
1805691--1806136
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2.0
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734
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1.94
1813672--1813813
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2.6
54
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16
23
22
36
1.94
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5.2
26
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2.1
137
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250
26
19
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24
1.98
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3
309
26
20
30
23
1.98
1826923--1827182
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1.9
139
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7
343
26
20
30
23
1.98
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2
20.5
2
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0
0
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2.0
29
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0
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0
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0
0
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23
2.0
24
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62
35
8
8
47
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1856952--1856995
21
2.1
21
83
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25
9
2
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1.35
1862631--1862714
26
3.2
26
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0
150
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5
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35
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26
5.2
26
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209
34
5
23
37
1.78
1864098--1864229
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2.6
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7
205
34
5
23
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25
3.0
22
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22
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1869928--1870061
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1873442--1873723
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137
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2.9
87
86
5
345
26
17
20
35
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425