Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   

This is table  92  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26660286--26660332
24
1.9
24
82
4
58
57
4
6
31
1.43
26660814--26660877
27
2.4
27
91
0
101
21
25
28
25
1.99
26661030--26661058
14
2.1
14
100
0
58
51
6
0
41
1.28
26661030--26661237
64
3.3
62
73
15
167
41
6
5
46
1.53
26661022--26661122
50
2.0
50
92
0
166
39
6
5
47
1.55
26660966--26661177
114
1.9
113
92
1
361
40
6
7
46
1.57
26661144--26661172
14
2.1
14
100
0
58
51
6
0
41
1.28
26661208--26661237
14
2.1
14
100
0
60
53
6
0
40
1.27
26661604--26661718
33
3.5
33
73
2
97
29
19
32
19
1.96
26662553--26662586
14
2.4
14
100
0
68
44
5
14
35
1.70
26664555--26664599
16
2.9
16
90
3
65
0
33
0
66
0.92
26667282--26667342
30
2.0
30
87
0
86
29
21
8
40
1.82
26668217--26668243
5
5.4
5
100
0
54
18
0
0
81
0.69
26677756--26677858
29
3.6
27
78
5
89
28
32
16
23
1.96
26689557--26689589
17
2.1
16
88
11
50
30
0
0
69
0.88
26689638--26689701
21
3.1
21
72
14
53
25
0
6
68
1.12
26689664--26689712
26
2.0
24
88
8
71
30
0
6
63
1.19
26698186--26698244
26
2.4
25
91
5
93
44
1
18
35
1.60
26699768--26699848
20
3.9
20
70
9
63
23
12
25
38
1.90
26699766--26699857
43
2.2
43
92
2
150
25
10
25
39
1.88
26701040--26701172
42
3.2
42
96
2
250
20
20
33
25
1.97
26712068--26712110
20
2.2
20
91
0
68
44
9
0
46
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26714162--26714223
26
2.4
26
94
0
106
35
4
4
54
1.43
26717693--26717728
18
1.9
19
94
5
65
38
16
25
19
1.92
26717706--26717818
45
2.5
44
81
2
127
39
17
19
23
1.92
26717796--26717820
12
2.1
12
100
0
50
40
20
24
16
1.91
26719192--26719252
24
2.5
23
80
15
61
49
4
0
45
1.23
26719200--26719279
35
2.3
35
85
8
103
50
5
0
45
1.23
26721050--26721219
49
3.6
47
80
7
184
25
29
16
28
1.97
26721380--26721411
16
2.0
16
93
0
55
37
15
6
40
1.73
26723363--26723422
18
3.3
18
75
9
59
11
35
8
45
1.71
26725561--26725679
57
2.1
58
87
6
170
45
7
21
26
1.78
26725738--26725828
45
2.0
45
97
0
173
40
8
12
38
1.73
26728450--26728517
33
2.1
33
100
0
136
27
0
11
60
1.32
26728456--26728519
19
3.7
19
74
21
77
28
0
10
60
1.30
26739841--26739879
21
1.9
20
85
15
53
51
20
0
28
1.48
26743974--26744016
17
2.6
17
88
3
61
27
9
20
41
1.83
26746380--26746435
28
2.0
28
100
0
112
39
3
17
39
1.67
26747343--26747505
47
3.5
46
83
4
202
12
19
24
43
1.86
26747635--26747689
18
2.9
19
81
5
76
30
5
12
50
1.63
26747635--26747705
18
3.9
18
77
1
70
32
7
15
45
1.73
26750619--26750688
27
2.5
28
97
2
133
28
12
27
31
1.93
26753291--26753330
19
2.1
19
100
0
80
32
15
0
52
1.43
26754047--26754219
93
1.9
93
88
0
265
28
29
19
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26754040--26754211
46
3.7
46
70
16
120
29
29
19
22
1.98
26760678--26760780
29
3.6
29
81
2
118
23
16
32
28
1.96
26768668--26768770
29
3.6
29
81
2
118
23
16
32
28
1.96
26775455--26775620
40
4.1
40
86
0
206
22
27
23
26
2.00
26778403--26778624
40
5.7
40
89
1
290
22
22
27
27
1.99
26786576--26786785
40
5.3
41
85
4
236
23
21
27
26
1.99
26791041--26791171
65
2.0
65
96
0
244
41
17
14
25
1.88
26791174--26791230
26
2.2
26
80
3
60
28
19
17
35
1.94
26791644--26791741
49
2.0
49
87
0
142
28
31
18
21
1.97
26793639--26793689
16
3.2
16
85
0
66
17
17
19
45
1.86
26800478--26800517
21
1.9
21
84
0
53
55
10
2
32
1.47
26801137--26801655
259
2.0
259
98
0
1011
32
8
16
42
1.79
26803002--26803031
12
2.5
12
94
0
51
6
23
40
30
1.80
26805316--26805340
13
1.9
13
100
0
50
32
16
16
36
1.90
26806799--26807214
48
8.7
48
96
0
751
33
7
26
31
1.85
26807259--26807381
37
3.3
37
96
0
228
25
18
31
24
1.98
26809525--26809566
17
2.4
18
80
4
50
50
7
0
42
1.30
26813856--26813970
29
4.0
28
76
8
97
27
29
14
27
1.95
26816067--26816202
28
4.6
31
79
8
149
27
12
27
33
1.92
26816065--26816198
59
2.3
59
98
0
259
26
12
27
32
1.93
26816097--26816225
28
4.5
28
83
6
179
27
12
27
32
1.93
26818193--26818224
16
2.0
16
100
0
64
12
6
31
50
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26820104--26820460
180
2.0
180
95
0
642
37
16
10
35
1.84
26821510--26821623
43
2.6
44
78
10
119
24
28
22
24
2.00
26823501--26823530
15
2.1
15
93
6
53
36
26
6
30
1.82
26823876--26823933
30
2.0
29
96
3
107
31
24
18
25
1.98
26835229--26835323
42
2.3
42
87
3
129
38
15
18
26
1.91
26835718--26835794
29
2.7
29
83
0
100
28
29
15
25
1.96
26838675--26838899
124
1.8
124
85
1
317
30
11
23
34
1.90
26838894--26839023
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
26838856--26839023
80
2.1
80
81
6
198
25
23
27
23
2.00
26846718--26846942
124
1.8
124
85
1
317
30
11
23
34
1.90
26846937--26847066
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
26846899--26847066
80
2.1
80
81
6
198
25
23
27
23
2.00
26851301--26851331
14
2.2
14
100
0
62
38
25
0
35
1.56
26860260--26860509
80
3.2
80
82
4
249
24
27
22
25
2.00
26860285--26860505
40
5.6
40
84
3
218
24
28
22
24
2.00
26868518--26868728
40
5.3
40
81
3
239
26
27
22
23
2.00
26872306--26872530
48
4.7
47
78
11
199
21
29
21
27
1.98
26872258--26872527
96
2.8
96
82
2
283
21
28
21
28
1.99
26877561--26877925
46
8.0
46
90
1
473
21
24
15
38
1.92
26877561--26877925
137
2.7
138
87
1
518
21
24
15
38
1.92
26880055--26880105
19
2.7
19
82
11
61
54
5
0
39
1.24
26882927--26883290
46
8.0
46
91
1
482
21
24
15
38
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26885421--26885471
19
2.7
19
82
11
61
54
5
0
39
1.24
26905160--26905367
40
5.2
40
82
0
200
25
23
25
25
2.00
26905161--26905367
80
2.6
80
81
4
229
25
23
25
25
2.00
26912693--26912740
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
26912784--26912842
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86
26912788--26912842
11
5.4
11
70
16
55
38
10
20
30
1.87
26912893--26913035
24
6.0
24
91
4
209
28
22
22
26
1.99
26912893--26913035
47
3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
26912893--26913036
71
2.0
72
89
4
220
29
22
22
26
1.99
26913227--26913289
31
2.1
31
90
3
101
36
15
23
23
1.94
26920825--26920872
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
26920916--26920974
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86
26920920--26920974
11
5.4
11
70
16
55
38
10
20
30
1.87
26921025--26921143
24
5.0
24
88
5
170
28
21
22
26
1.99
26921025--26921143
47
2.5
48
89
5
170
28
21
22
26
1.99
26921335--26921428
31
3.1
31
95
1
163
37
15
23
23
1.93
26924204--26924411
40
5.2
39
79
5
157
26
22
25
25
2.00
26924205--26924411
80
2.6
80
81
4
220
26
22
25
25
2.00
26940107--26940254
42
3.4
43
79
8
158
26
19
25
28
1.99
26942102--26942140
20
2.0
20
94
0
69
38
33
0
28
1.57
26943283--26943486
27
7.6
27
87
4
268
29
23
7
39
1.82
26943250--26943487
54
4.4
53
85
5
266
30
24
7
37
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26943281--26943487
81
2.6
81
88
1
317
29
23
7
39
1.83
26943478--26943602
27
4.7
27
87
3
164
40
21
12
25
1.88
26943478--26943620
27
5.4
25
81
9
126
39
20
13
25
1.90
26945930--26946103
46
3.8
46
75
13
185
21
19
28
29
1.98
26945925--26946096
93
1.8
93
92
0
290
22
19
28
29
1.98
26950063--26950294
27
8.6
27
85
1
286
29
22
7
40
1.81
26950271--26950437
27
6.2
27
79
12
182
39
24
8
26
1.85
26950042--26950302
81
3.2
81
83
3
312
31
23
7
37
1.82
26950163--26950410
81
3.1
81
78
4
225
35
24
8
32
1.85
26950284--26950440
81
1.9
81
90
2
253
40
24
9
26
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425