Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  1  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7387--7449
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0
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3
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22
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22
1.9
22
90
5
66
41
19
4
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1.73
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2.0
180
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18
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2.0
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2.0
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2.7
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3.1
26
80
14
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50
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2.0
95
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2
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33
9
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49
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56721--56760
15
2.8
14
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3
53
47
2
7
42
1.45
56722--56766
14
3.1
14
84
6
54
44
2
8
44
1.47
56814--56868
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2.6
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0
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1
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17
17
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77015--77221
30
6.3
30
83
12
198
15
21
39
23
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
268
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21
39
22
1.91
79652--79704
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2.2
23
81
12
70
37
5
1
54
1.35
81688--81725
2
18.5
2
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5
58
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2
2
47
1.30
84613--84655
18
2.4
18
84
0
59
41
0
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13
1.44
87826--87928
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4
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3
98
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20
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2.5
18
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0
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0
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2.0
24
100
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42
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104948--104990
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2.0
22
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4
13
18
1.48
115280--115310
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0
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19
28
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2.0
147
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0
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39
25
12
23
1.89
122610--122682
9
8.3
9
78
14
64
28
0
2
68
1.03
122607--122659
19
2.8
19
81
13
65
37
0
1
60
1.08
122617--122662
10
4.8
10
77
20
53
36
0
0
63
0.95
122610--122688
16
4.6
17
73
14
63
30
0
3
65
1.10
122610--122683
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8.6
8
77
12
51
29
0
2
67
1.04
122761--122812
25
2.1
25
85
0
68
25
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9
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8.7
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100
0
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0
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14.0
3
100
0
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0
0
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139896--139929
14
2.4
14
86
13
52
47
8
0
44
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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0
0
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2.0
36
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1.80
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2.3
16
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4
58
26
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2
57
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2.0
119
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0
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15
33
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12
78
0
53
34
26
12
26
1.92
173513--173564
27
1.9
27
92
0
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11
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2.0
43
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0
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13
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44
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184292--184342
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2
95
0
93
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0
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5
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14
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2.0
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0
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16
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2.0
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20
15
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22
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1.91
187347--187499
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241
23
22
15
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1.93
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1.8
116
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0
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
213978--214018
2
20.5
2
89
0
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0
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2.1
17
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1.60
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5.0
19
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13
65
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2
4
59
1.28
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20
3.2
19
93
6
99
41
1
4
52
1.32
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2
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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22
2.0
22
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0
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22
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1.72
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5
6.0
5
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0
51
0
20
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0
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0
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49
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0
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36
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0
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0
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16
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0
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0
41
1.27
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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0
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0
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0
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0
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0
0
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0
0
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14
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22
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0
0
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2.7
27
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0
0
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6
7.8
6
82
8
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14
2
34
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
26
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1.57
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4.3
16
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1
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1.57
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19
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4
59
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0
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0
1.00
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0
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0
0
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1.00
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0
0
51
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438