Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr03 135709677 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  9  of  438  ( 52554 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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0
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0
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4
22
0
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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2.0
222
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8.7
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95
0
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1
7
69
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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50
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37
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2727128--2727154
12
2.2
12
100
0
54
22
0
40
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1.54
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15
2.0
15
93
0
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36
6
0
56
1.26
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39
3.6
38
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2
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5
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26
1.73
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24
2.0
24
100
0
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25
16
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1
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1.17
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17
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0
0
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1.00
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2.0
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19
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0
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2.0
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2.0
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18
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30
2.1
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12
1
29
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2818658--2818707
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2.0
18
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0
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2.0
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22
2.0
22
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22
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26
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54
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9
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0
76
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2871295--2871385
41
2.2
40
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4
0
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118
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1
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0
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36
22
21
18
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438