Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  433  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
133368460--133369025
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7.5
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19
17
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1.96
133368790--133369027
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3.0
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107
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2.0
20
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0
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0
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17
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18
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16
37
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
37
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18
16.1
18
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9
150
34
12
15
37
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3.0
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0
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2.5
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10
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0
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4.3
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1.91
133446898--133447051
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2.7
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2
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2
27
1.18
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2.2
22
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2.3
381
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24
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25
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22
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3.0
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30
17
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2.0
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0
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1.10
133510098--133510152
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2.0
27
82
6
67
56
1
0
41
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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133510099--133510185
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2.4
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56
1
0
42
1.07
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3.2
13
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52
18
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70
1.27
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0
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1.00
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1.33
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1.9
19
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1.85
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20
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0
3
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2
0
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1.14
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11
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11
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2
0
45
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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1.9
308
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1.96
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29
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29
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19
5
37
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
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0
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0
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0
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48
14
10
26
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.9
23
90
0
70
77
6
4
11
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          433   434   435   436   437   438