Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  428  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
132009429--132009506
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3.2
26
64
17
67
41
3
19
35
1.70
132009409--132009505
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2.1
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1
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15
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1.62
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24.8
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114
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3
1
60
1.24
132010554--132010609
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2.8
20
75
0
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30
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1
62
1.28
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0
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22
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57
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1.50
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3.9
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22
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1.67
132017234--132017369
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2.3
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2
22
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1.69
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2.1
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117
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21
27
1.70
132029326--132029470
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148
64
7
2
26
1.32
132029696--132029745
26
2.0
25
84
4
64
48
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12
32
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
132030939--132030976
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2.1
18
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51
65
2
5
26
1.27
132031098--132031146
24
2.0
25
84
4
64
55
6
4
34
1.44
132031253--132031317
11
6.2
11
78
10
73
53
4
1
40
1.31
132031184--132031290
57
1.9
56
85
12
148
51
6
6
35
1.54
132031239--132031309
33
2.1
34
87
7
101
52
4
4
39
1.41
132031280--132031339
19
3.3
18
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9
68
58
1
0
40
1.08
132031281--132031321
2
22.0
2
80
14
52
53
2
0
43
1.13
132031281--132031355
22
3.2
24
77
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66
53
1
2
42
1.23
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0
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0
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2.3
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20
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0
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1.33
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1
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19
18
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1.94
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7
5.6
7
84
3
51
55
2
2
39
1.28
132045993--132046039
14
3.4
14
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2
60
53
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2
38
1.39
132049004--132049309
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6.6
46
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366
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23
22
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20
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1.97
132052463--132052683
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3.0
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85
2
275
27
19
20
32
1.97
132054949--132055082
35
3.6
37
81
9
159
35
23
10
31
1.88
132056491--132056588
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
132057963--132058070
44
2.4
44
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144
29
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13
33
1.93
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44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
132072692--132072799
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
132076020--132076058
13
3.0
13
92
7
62
23
25
30
20
1.98
132080629--132080701
28
2.6
28
80
10
94
49
2
1
46
1.24
132081261--132081337
28
2.6
30
81
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86
36
1
6
55
1.34
132081757--132081867
54
2.1
54
96
0
204
43
11
12
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1.79
132086569--132086675
28
3.8
28
91
0
151
34
10
24
30
1.89
132089132--132089162
15
2.1
15
93
0
53
54
0
0
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7
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1.36
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14
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26
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0
0
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0.63

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438