Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  10  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2889050--2889101
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19
1
0
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0
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0
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0
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10
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0
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0
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3
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1.94
2894806--2895089
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2.0
143
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2
433
31
20
16
32
1.94
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18
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21
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126
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1
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20
16
29
1.95
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199
2.5
194
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539
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22
15
28
1.94
2895302--2895532
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1.9
126
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2
351
35
22
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1.94
2895428--2895861
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5.7
75
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560
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22
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1.95
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21
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29
1.95
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16
1.9
16
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0
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64
6
12
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2.0
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19
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1.94
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2.9
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393
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19
16
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3.2
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20
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4.4
11
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19
55
0
6
8
85
0.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
73
15
51
1
9
5
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0.88
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17
2.2
18
95
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69
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10
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0
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0
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0
0
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29
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2.0
23
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0
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2.1
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26
20
25
1.99
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5.0
41
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237
27
26
20
25
1.99
2910344--2910517
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2.1
82
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21
21
22
35
1.96
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2.9
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134
20
20
22
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1.95
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2.3
31
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6
8
35
1.59
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3.9
38
88
5
190
46
5
18
29
1.71
2921502--2921543
19
2.2
19
100
0
84
23
11
4
59
1.51
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4.5
13
70
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50
35
1
3
59
1.24
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24
2.0
26
84
7
68
40
2
4
54
1.31
2925638--2925668
15
2.1
15
100
0
62
54
0
38
6
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2933525--2934705
419
2.8
413
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4
1646
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18
22
30
1.97
2933525--2934705
210
5.7
210
85
5
1492
29
18
22
30
1.97
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1.9
45
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0
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27
12
30
29
1.93
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18
1.9
19
89
10
58
43
0
8
48
1.32
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3.8
39
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2
183
46
5
18
29
1.71
2936098--2936247
77
1.9
78
83
4
196
46
5
19
29
1.72
2936760--2936808
24
2.0
26
84
8
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40
2
4
53
1.32
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18
1.9
19
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56
22
13
0
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1.29
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2.7
24
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0
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0
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0
0
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50
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13
22
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23
26
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2.0
21
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23
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23
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22
76
33
4
4
56
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3024374--3024454
30
2.7
29
81
9
92
34
1
9
54
1.42
3024462--3024490
15
1.9
15
100
0
58
37
0
6
55
1.27
3024466--3024513
19
2.6
19
81
15
64
35
0
8
56
1.30
3025193--3025337
30
4.8
30
87
1
186
27
47
4
20
1.68
3025844--3025967
59
2.2
57
80
9
130
37
4
3
55
1.35
3025932--3025992
29
2.2
29
82
5
72
34
4
3
57
1.36
3025926--3026006
25
3.0
26
73
14
76
33
6
3
56
1.42
3025997--3026043
25
2.0
24
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8
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8
2
51
1.45
3026197--3026244
16
3.1
15
90
6
69
31
2
2
64
1.16
3026197--3026248
8
6.5
8
82
8
61
30
1
1
65
1.14
3028301--3028341
13
2.9
15
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17
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53
0
2
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1.13
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17
1.9
17
100
0
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9
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1.60
3030160--3030200
16
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15
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0
4
48
1.23
3038390--3038445
24
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26
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6
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23
3
35
1.72
3044115--3044172
26
2.2
26
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0
107
37
24
3
34
1.72
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18
2.2
18
86
0
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30
27
25
17
1.97
3055392--3055441
15
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15
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20
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2
4
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1.21
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2.0
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17
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1.39
3057594--3057650
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3
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5
0
42
1.24
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28
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28
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1.95
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27
2.8
27
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35
22
21
21
1.96
3066198--3066246
18
2.7
19
78
9
66
63
0
32
4
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3066198--3066254
18
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17
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0
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3
1.10
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2.0
15
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0
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39
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0
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19
1.98
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4.2
28
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23
19
1.96
3073326--3073441
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2.1
55
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7
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2.0
15
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0
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0
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0
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0
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2.3
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2.0
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0
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13
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0
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1.96
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20
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1.96
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2.1
136
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25
18
24
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184
36
24
4
33
1.76
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11
2.9
10
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9
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56
10
10
23
1.62
3118669--3118719
21
2.3
23
75
25
56
50
15
9
23
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3119578--3119862
136
2.1
136
98
0
552
31
25
18
24
1.98
3119869--3119915
21
2.3
20
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3
58
34
51
2
12
1.52
3120108--3120159
25
2.0
26
85
3
70
25
13
23
38
1.91
3121643--3121752
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2
159
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0
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0
0
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0
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19
2.3
19
88
8
61
59
2
2
35
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438