Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  387  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120734992--120735161
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0
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2.6
62
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0
274
16
18
16
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1.81
120735832--120735942
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109
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95
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283
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1.90
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116
37
17
13
30
1.89
120769028--120769130
44
2.3
44
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3
127
31
13
24
31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.1
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2
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120772494--120772567
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2.7
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33
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17
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2
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2.1
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2.0
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22
36
1.84
120774679--120774874
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2.3
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220
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20
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1.81
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59
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0
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50
1
0
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1.11
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20
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1.81
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22
2.7
20
82
17
69
57
1
0
41
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120787823--120787909
21
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1
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0
0
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1.8
136
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35
1.88
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3.2
24
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1.91
120790802--120790905
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2.2
48
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111
39
19
20
21
1.93
120793909--120794016
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4.2
26
88
4
164
35
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8
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1.85
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2.3
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1.57
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27
1.98
120838276--120838356
43
1.9
42
89
2
126
20
32
22
24
1.98
120838516--120838622
28
3.8
28
89
0
142
28
25
12
33
1.92
120839820--120839970
43
3.5
43
79
5
137
26
13
24
35
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120842049--120842158
44
2.4
45
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3
150
34
13
22
29
1.93
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17
1.9
18
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5
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50
0
0
50
1.00
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2.3
15
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9
6
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54
1.56
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49
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4
138
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15
28
1.84
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1.9
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2
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1.33
120850753--120850808
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2.8
20
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25
0
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1.54
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18
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18
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0
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2
2
28
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3
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0
0
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2.0
21
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1.02
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0
0
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100
0
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15
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2
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0
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0
0
50
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24
25
25
2.00
120859601--120859705
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22
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23
24
2.00
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0
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0
0
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1.96
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1.93
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2
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1.94
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29
1.95
120893408--120893548
42
3.3
43
79
5
142
23
17
26
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120893467--120893559
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12
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25
17
24
32
1.97
120896239--120896298
9
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1.84
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1.88
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2.3
19
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1.89
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1.99
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214
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29
1.97
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1.63
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1.99
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20
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0
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0
0
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0
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0.75
120952810--120952859
14
3.7
14
81
10
68
84
4
0
12
0.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120952809--120952859
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0
11
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2.0
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0
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1.98
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245
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0
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20
1.98
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2.5
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14
60
28
23
0
47
1.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433   434   435   436   437   438