Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  14  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.69
Indices
Period
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Copy
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Score
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1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3984320--3984483
71
2.3
71
97
0
310
18
28
18
34
1.95
3984320--3984517
71
2.8
70
90
3
249
20
28
17
32
1.96
3991878--3992041
71
2.3
71
97
0
310
18
28
18
34
1.95
3991878--3992075
71
2.8
70
90
3
249
20
28
17
32
1.96
3995946--3996010
30
2.1
31
83
8
80
38
0
12
49
1.41
4001512--4001650
69
2.0
69
95
0
251
28
31
13
25
1.94
4006793--4006828
17
2.2
17
90
5
56
61
11
0
27
1.30
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2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
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22
2.7
21
83
5
62
56
1
3
37
1.26
4016110--4016196
31
2.9
30
74
12
81
37
9
11
41
1.73
4018118--4018142
10
2.5
10
100
0
50
48
0
0
52
1.00
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2.1
21
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0
79
31
15
11
40
1.83
4033654--4033829
46
3.8
46
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14
200
20
21
29
28
1.98
4033650--4033822
93
1.9
93
93
2
303
20
21
30
27
1.98
4047852--4047877
2
13.0
2
100
0
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0
0
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2
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0
58
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0
0
48
1.00
4056584--4056636
3
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0
1
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1.01
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0
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3
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3
100
0
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0
33
33
1.58
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20
2.1
20
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0
75
33
19
11
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1.88
4065312--4065356
13
3.5
13
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0
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24
4
31
40
1.75
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5
11.0
5
84
12
65
42
0
1
55
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4074767--4074858
23
4.0
23
76
18
75
43
1
2
53
1.20
4074764--4074859
13
6.9
14
74
22
87
43
1
2
53
1.19
4074763--4074861
7
14.3
7
69
14
53
45
1
2
51
1.19
4076037--4076102
22
3.0
23
80
6
73
18
24
18
39
1.92
4079597--4079745
50
3.0
50
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2
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35
14
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1.93
4079758--4079990
31
7.5
31
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0
340
30
19
25
25
1.98
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7
4.1
7
100
0
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27
13
1.82
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24
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0
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0
31
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13
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0
2
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15
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14
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25
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53
1
1
42
1.23
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100
0
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0
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2.0
27
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64
0
7
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1.21
4093777--4093817
18
2.2
19
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29
24
0
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1.53
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28
27
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4094314--4094352
18
2.1
19
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10
0
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5
100
0
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0
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63
2
0
34
1.08
4097115--4097184
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2.4
31
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37
4
7
51
1.49
4097264--4097314
25
2.0
25
92
0
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25
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4103224--4103318
40
2.4
40
75
7
95
46
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1.79
4106317--4106760
114
3.9
114
91
4
673
31
0
15
52
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4106819--4106849
15
2.0
16
93
6
55
38
0
6
54
1.26
4109510--4109596
21
4.0
23
80
10
92
37
25
21
14
1.92
4109968--4110025
15
3.8
15
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2
89
51
12
0
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1.39
4111291--4111327
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7.2
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56
0
0
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0
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0
0
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27
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2.00
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0
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24
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86
36
1
0
62
1.05

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438