Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  438  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
135307637--135307715
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15
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1
22
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0
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0
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108
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0
396
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4
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2.0
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0
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0
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2.0
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0
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0
2
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0
0
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16
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2
26
1.19
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2.0
39
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48
10
1
40
1.45
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0
0
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1.50
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10
22
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1.87
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2.0
40
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10
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5
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13
3.3
13
87
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54
4
11
6
77
1.11
135387086--135387120
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2.7
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95
0
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2
8
11
77
1.10
135395577--135395610
17
1.9
17
94
5
59
29
0
2
67
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
135400125--135400243
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1.9
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1
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12
21
1.90
135401068--135401120
21
2.4
23
87
6
74
43
9
0
47
1.36
135404912--135404970
4
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4
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10
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50
25
0
23
1.49
135416676--135416726
25
2.0
25
100
0
102
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3
43
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16
3.6
16
74
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62
15
19
0
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1.28
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13
50
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12
2.9
12
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52
11
51
0
37
1.38
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2.0
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91
31
12
20
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57
2.0
57
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12
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12
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0
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62
0
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0
0
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100
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7
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63
0
2
34
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135489156--135489348
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1.9
104
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11
34
1.79
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24
2.0
24
100
0
98
24
22
8
44
1.79
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2.1
16
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52
0
0
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1.00
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64
45
0
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49
1.24
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2.0
116
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31
12
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39
1.86
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47
3.8
49
78
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191
29
28
20
21
1.98
135517250--135517421
94
1.8
93
92
1
290
29
29
20
20
1.98
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20
1.9
18
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10
56
35
21
0
43
1.53
135521462--135521641
47
3.8
49
81
15
227
28
28
20
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
135521469--135521641
94
1.8
93
93
1
301
28
28
20
21
1.98
135531536--135531579
18
2.4
19
80
7
54
61
0
0
38
0.96
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27
2.8
28
73
15
70
38
1
2
57
1.21
135531953--135532039
35
2.3
39
80
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101
42
4
0
52
1.21
135532036--135532081
22
2.1
22
88
4
67
32
0
4
63
1.14
135532055--135532104
10
4.9
10
80
4
55
30
2
4
64
1.23
135532046--135532102
21
2.7
21
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8
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33
1
3
61
1.23
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2.2
25
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0
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1.60
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11
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10
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19
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34
1.91
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35
3.6
34
83
4
153
34
21
14
29
1.93
135580787--135580956
35
4.9
34
79
4
151
33
20
14
31
1.93
135580787--135580959
69
2.5
70
75
0
177
33
20
14
31
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
135582633--135582681
26
2.0
24
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11
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69
2
0
28
1.00
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19
2.0
19
94
0
67
34
10
7
47
1.67
135591993--135592031
19
2.1
19
100
0
78
48
10
10
30
1.70
135598811--135598862
26
2.1
26
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7
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3
5
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1.42
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2.0
361
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0
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13
24
32
1.94
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19
2.2
20
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4
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27
18
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46
1.75
135611264--135611442
47
3.8
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191
29
29
20
21
1.98
135611272--135611442
94
1.8
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2
297
28
29
20
21
1.98
135614808--135614968
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8
184
24
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20
23
1.98
135614851--135615013
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3.6
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22
32
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25
1.97
135617441--135617620
47
3.8
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15
200
28
29
20
21
1.98
135617449--135617620
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1.8
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93
1
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28
29
20
20
1.98
135620702--135620881
47
3.8
49
80
15
209
29
29
20
21
1.98
135620710--135620881
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1.8
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29
29
20
20
1.98
135625708--135625841
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26
1.94
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23
2.0
23
100
0
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36
1.94
135633103--135633217
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2.6
44
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2
149
35
13
22
27
1.92
135633103--135633236
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3.0
45
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4
153
35
14
23
26
1.93
135634417--135634460
22
2.0
23
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4
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13
27
27
31
1.94
135636014--135636142
44
2.8
45
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4
152
34
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24
27
1.93
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2.1
22
100
0
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26
30
1.97
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44
3.0
45
81
4
144
35
14
23
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
32
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0
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26
22
24
26
2.00
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0
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1
0
26
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2.0
20
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2
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0
0
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0
0
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0
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0
0
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1.45
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0
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0
0
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2.0
120
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100
0
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8
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145
23
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1.94
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2.3
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0
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1.9
30
92
0
98
58
10
0
31
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
135700823--135700898
14
5.6
14
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3
2
21
1.13
135700827--135700910
11
7.8
11
76
4
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3
2
22
1.13
135706162--135706220
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135709470--135709501
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2.0
16
100
0
64
43
6
25
25
1.77

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438

The End!