Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  320  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100158883--100159041
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5.9
27
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23
18
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100158901--100159041
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2.6
54
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221
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23
22
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1.95
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2.8
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2.2
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0
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35
26
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1.83
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5.5
30
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222
33
13
25
27
1.94
100166228--100166387
59
2.8
57
89
4
223
33
13
25
27
1.94
100174148--100174307
29
5.5
30
88
8
222
33
13
25
27
1.94
100174148--100174307
59
2.8
57
89
4
223
33
13
25
27
1.94
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50
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13
2
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2.0
125
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19
16
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100228319--100228409
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2.8
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17
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29
1.82
100231640--100231706
33
2.0
33
97
0
125
28
13
17
40
1.88
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42
2.0
42
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10
30
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13
3.0
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13
26
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24
24
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379
24
22
19
33
1.97
100261250--100261630
76
5.1
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76
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24
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1.9
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0
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2
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0
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0
0
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61
0
0
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2.4
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70
0
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1.11
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53
50
0
3
46
1.18
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2
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82
53
1
1
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1.21
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100
50
0
0
50
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40
12
19
26
1.88
100277571--100277617
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3.2
15
81
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60
36
2
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0
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0
0
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1.00
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2.2
19
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12
59
46
0
24
29
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100288070--100288590
47
11.1
47
86
3
735
33
11
29
25
1.91
100288070--100288636
141
4.0
141
87
3
845
33
11
29
25
1.91
100288490--100288564
23
3.2
23
63
29
59
32
10
29
28
1.90
100288092--100288590
94
5.3
94
96
0
892
33
11
29
25
1.91
100292217--100292342
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3.2
39
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0
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19
23
1.98
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1.9
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1.91
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2.0
136
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20
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1.97
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1.9
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100
0
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1.84
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2.5
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20
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16
28
1.97
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10
193
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18
26
1.98
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1.97
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50
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3
1
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2.6
12
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0
53
32
3
0
64
1.09
100331385--100331449
22
3.0
24
78
17
70
36
3
1
58
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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10
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100331499--100331532
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11
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26
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24
17
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
33
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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0
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0.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          433   434   435   436   437   438