Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  430  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
132629970--132629994
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0
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0
0
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2.1
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0
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12.6
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1.87
132645282--132645888
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19
22
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0
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0
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1596
34
17
14
33
1.90
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4.6
212
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34
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0
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0
0
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2.5
14
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14
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33
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9
51
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
22
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12
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28
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2.0
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1
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1.37
132683058--132683108
26
2.0
25
85
11
68
31
7
1
58
1.37
132689026--132689098
26
2.9
25
78
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1
2
50
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0
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91
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18
81
30
12
0
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1.36
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37
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42
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100
0
52
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0
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2.4
24
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5
82
75
0
0
24
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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78
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11
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1.87
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45
2.0
45
100
0
180
22
24
15
37
1.93
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30
2.9
30
77
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90
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1
18
43
1.57
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0
0
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51
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0
1.00
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100
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23
1.93
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1.9
16
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50
0
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2
1.16
132763413--132763726
125
2.5
125
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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24
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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0
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0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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3
0
61
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          433   434   435   436   437   438