Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  241  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74748396--74748500
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0
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0
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22
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74771627--74771810
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1.9
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280
30
25
15
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1.95
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40
5.6
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25
2.00
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2.2
80
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25
22
26
2.00
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0
170
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30
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1.98
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175
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1.98
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4.2
39
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0
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22
20
32
24
1.98
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120
24
23
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22
1.99
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1.99
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22
1.99
74807572--74807782
75
2.8
75
89
5
302
24
25
28
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1.99
74807526--74807792
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39
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24
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28
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250
25
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24
2.00
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2.3
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20
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27
23
31
17
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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75
0
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20
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74822593--74822677
24
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76
20
88
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0
3
21
0.95
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2.9
20
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19
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1
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22
1.21
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0
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0
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14
29
1.94
74829228--74829408
98
1.8
100
83
7
242
32
23
14
29
1.94
74831301--74831379
19
4.2
19
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9
117
36
10
17
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1.84
74831291--74831378
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2.4
36
78
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110
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17
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1
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0
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2.0
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89
89
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27
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132
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17
24
27
1.97
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2.1
44
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0
132
32
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25
1.95
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2.2
205
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1.98
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45
3.1
44
82
6
159
30
16
28
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74840872--74840933
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2.0
62
98
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239
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16
22
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1.95
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56
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19
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1.93
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4.0
43
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191
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14
27
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1.94
74855542--74855700
86
1.9
85
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212
23
15
27
33
1.95
74855676--74855803
63
2.0
63
98
0
247
23
18
23
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1.96
74865285--74865335
22
2.3
22
82
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25
0
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0
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16
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52
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0
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1.40
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18
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2.3
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1.57
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1.9
94
86
2
257
22
28
19
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
1.98
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1.94
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107
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1.98
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1.99
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2.00
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1
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25
25
22
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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25
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1
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25
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26
2.00
74984099--74984306
80
2.6
80
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25
22
26
2.00
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2
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17
24
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75018801--75018932
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25
1.94
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2.00
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160
26
22
26
23
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438