Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  375  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117193982--117194027
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5
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0
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20
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1.8
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1
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28
28
21
21
1.99
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2.8
72
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1.98
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1.9
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0
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22
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117225098--117225284
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2.7
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18
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117225121--117225284
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2.3
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100
0
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18
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1.94
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2.8
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0
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1.95
117229705--117229864
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1.8
87
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0
194
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1
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29
10
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29
4.7
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24
30
15
29
1.95
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2.8
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1.95
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143
2.1
141
98
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563
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8.2
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2
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20
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19
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50
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0
0
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22
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0
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26
14
2
57
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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55
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10
7
35
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18
2.1
18
100
0
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2
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0
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33
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2.5
55
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0
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18.0
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0
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117330693--117330728
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3.0
12
95
0
63
44
5
0
50
1.25
117330889--117330928
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20.5
2
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0
0
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57
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1.9
30
96
0
107
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0
17
27
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117333557--117333641
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2.1
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12
1.80
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3.8
19
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18
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60
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1
33
1.24
117339365--117339397
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2.1
16
100
0
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42
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12
24
1.86
117340893--117340932
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0
2
57
1.12
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11
3.8
11
80
11
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2
2
47
1.27
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1.9
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0
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54
1.17
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20
22
1.56
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2.2
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19
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55
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18
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1.97
117370038--117370069
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15
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0
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25
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25
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117372002--117372109
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26
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0
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6
32
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117380712--117380809
24
4.0
24
70
10
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23
20
16
39
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117382779--117382893
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2.6
44
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2
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22
27
1.92
117382779--117382912
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4
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23
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1.93
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2.0
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0
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0
1
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21
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0
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0
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20
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25
2.00
117418715--117418921
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2.00
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1.99
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1.99
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15
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0
8
59
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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1.98
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26
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1.98
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2.0
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5
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1.97
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54
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3
131
32
18
15
34
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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1.93
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1.93
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0
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3
376
38
19
14
27
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438