Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  66  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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60
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3.0
13
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0
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2
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1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
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11
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2
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1.13
17258833--17258886
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20
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29
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3.0
30
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21
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28
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201
21
20
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29
1.98
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17291292--17291481
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87
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265
28
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29
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2.1
16
88
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9
33
0
57
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17307699--17307742
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1.9
23
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3
65
1.39
17338111--17338211
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17346026--17346126
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
17350772--17350889
31
3.5
35
88
11
128
22
23
16
37
1.93
17350795--17350889
31
3.1
31
98
0
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22
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38
1.92
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25
1.9
25
82
0
60
33
22
16
27
1.96
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20
2.8
20
91
0
94
39
10
17
32
1.84
17351640--17351733
47
2.0
49
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27
21
23
27
1.99
17351639--17351733
24
4.0
24
87
5
131
28
21
23
27
1.99
17351925--17352019
31
3.1
31
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0
172
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15
22
22
1.91
17354337--17354365
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6
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51
0
3
44
1.18
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15
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2
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2
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1.53
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21
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28
28
1.94
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23
1.97
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2.2
141
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22
28
20
27
1.99
17373583--17373886
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45
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14
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22
28
20
27
1.99
17375238--17375321
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25
19
1.94
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30
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1.95
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0
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1.99
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0
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28
28
1.98
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93
1.8
93
94
0
308
20
22
29
27
1.98
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28
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0
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20
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18
20
1.91
17395221--17395452
47
4.9
50
74
12
184
23
30
18
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17398688--17398726
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0
5
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23
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2.0
21
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0
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21
29
19
1.98
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18
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2
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0
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15
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19
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4.6
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227
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1.98
17414887--17415101
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1.98
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0
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1.96
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1.99
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1.80
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20
26
1.98
17426146--17426267
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2.6
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22
30
20
27
1.98
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1.98
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23
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1.98
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2.0
30
87
0
86
39
6
22
31
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17462818--17462965
64
2.2
68
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10
160
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22
1.96
17462842--17463025
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2.8
64
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8
194
28
16
30
23
1.96
17472284--17472463
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3.6
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234
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18
27
27
1.98
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0
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24
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24
2.00
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0
220
24
19
28
28
1.99
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0
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1.96
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1.99
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22
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1.99
17486785--17486934
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2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433   434   435   436   437   438