Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  376  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117572727--117572800
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0
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24
1.20
117572724--117572800
24
3.3
24
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10
81
67
1
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23
1.24
117572757--117572821
24
2.7
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84
64
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2.6
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23
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0
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1.9
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2.2
70
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31
10
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1.9
19
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2
5
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19
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18
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40
2
4
53
1.32
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18
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19
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45
1
7
45
1.39
117613213--117613258
20
2.4
19
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3
56
43
0
0
56
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6
29
1.31
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0
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3.7
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18
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25
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1.98
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2.0
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24
1.88
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2.3
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7
122
23
24
20
30
1.98
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2.6
22
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62
32
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1.56
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21
2.3
21
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0
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1.83
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5
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24
15
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
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20
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22
25
25
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1.9
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27
22
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25
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1.99
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22
1.99
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2.3
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1.99
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25
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1.99
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1.9
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26
22
1.99
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1.99
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31
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28
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38
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23
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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22
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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(0-2)
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0
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25
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15
8
6
68
1.36

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438