Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  410  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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2.5
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Indices
Period
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(0-2)
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15
2.2
14
94
5
55
0
9
0
90
0.45
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28
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29
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4
88
11
17
12
58
1.63
127632740--127632842
34
3.0
34
81
1
107
35
12
12
38
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
127633543--127633611
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2.7
25
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28
10
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46
1.77
127634473--127634551
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2.3
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80
8
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2
3
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1.31
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2
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2
100
0
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0
0
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0
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0
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1.34
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7
1
36
1.37
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39
2.0
39
100
0
158
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7
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208
29
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28
29
1.93
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20
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1.94
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0
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1.9
18
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1.92
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40
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0
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9
40
1.81
127670177--127670425
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2.1
120
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0
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40
1.81
127671769--127671803
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2.5
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0
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0
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127681849--127681933
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2.0
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0
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11
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1.83
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2.0
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0
1
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0
0
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16
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0
0
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0
0
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2.0
23
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4
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43
0
0
56
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1.55
127690358--127690486
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2.1
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1.96
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2.0
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0
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0
0
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0
0
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0.93
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0
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0
0
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0
0
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0
0
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0.94
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1.34
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3
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1.36
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0
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0
7
29
1.22
127735058--127735319
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6
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1.36
127735013--127735073
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6
18
1.33
127735319--127735350
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2.0
16
93
0
55
50
6
21
21
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
127735454--127735496
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0
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0
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0
0
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0
0
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5
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1.66
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4
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1.68
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0
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1.9
17
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11
50
63
3
6
27
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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          433   434   435   436   437   438